大うつ病、双極性障害、統合失調症などの重度の精神障害患者は、腸内細菌叢の様々な変化や腸管透過性の増加を示すことが、蓄積された証拠から示されている。 また、視床下部-下垂体-副腎（HPA）軸の調節障害や不顕性炎症が報告されています。 HPA軸の調節障害は、心理社会的ストレス、特にトラウマとなるようなライフイベントの結果として現れることが分かっていますが、その正確なメカニズムはまだ分かっていません。 動物モデル研究により、腸内細菌叢とHPA軸の機能障害を関連付けるいくつかのメカニズムが解明されている。 実際、腸内細菌叢は、血液脳関門を通過する微生物抗原、サイトカイン、プロスタグランジンなどのいくつかのメディエーターを通じてHPA軸を活性化することができる。 また、様々な微生物種が回腸のコルチコステロン産生に影響を与え、それがHPA軸の活性に影響を及ぼす可能性があるという証拠もある。 しかし、様々な微生物が放出するいくつかの代謝物、例えば短鎖脂肪酸は、HPA軸の反応を減衰させることができる。 さらに、いくつかの細菌は、迷走神経求心性神経と直接相互作用することができる神経伝達物質を放出します。 HPA軸の活性化は、腸内細菌叢と腸管透過性に影響を与えることが推測されている。 本稿では、腸内細菌叢とHPA軸の活性化を結びつける様々なメカニズムについて考察し、気分障害や精神病の患者を対象とした研究から、腸脳軸とHPA軸の間のクロストークに関する現在の証拠を要約する。 最後に，重症精神疾患における腸内細菌叢とHPA軸の活性を調査する今後の研究から生じうる臨床的意義を示す＜7659＞。