Na frente doméstica, o Presidente Roosevelt foi um dos Progressivos mais visíveis do seu tempo. Muitas de suas políticas domésticas envolveram o combate à grande indústria e à corrupção, numa tentativa de ajudar o homem comum. Ele ofereceu ao povo americano um SquareDeal para melhorar seu padrão de vida e exercer mais controle sobre grandes corporações ou trusts dominantes. Os trusts, que eram tecnicamente ilegais sob a Lei Sherman de 1890, tentaram consolidar os interesses empresariais para criar um monopólio sobre produtos específicos e eliminar a concorrência. Muitas empresas atacaram Roosevelt como socialista, mas ele refutou ardentemente essas acusações e refutou os princípios do marxismo. Na verdade, Roosevelt não desprezava as grandes empresas e, de fato, percebeu que os trusts tinham aumentado indiretamente o padrão de vida de quase todos os americanos na segunda metade do século XIX. Roosevelt, porém, não gostava do poder dos trusts e do fato de que o público americano tinha pouco controle sobre eles. Por outro lado, porém, ele também temia dar muito poder ao trabalho. Sua política do Square Deal tentou encontrar um equilíbrio entre os dois.
Roosevelt fez o primeiro grande teste doméstico quando 140.000 mineiros no leste da Pensilvânia entraram em greve na Greve do Carvão de 1902. O carvão foi uma fonte de energia vital para quase todos os americanos durante esta época, e a nação entrou em pânico durante a greve. Representada por John Mitchell, os mineiros formaram o Sindicato Unido dos Mineiros para exigir salários mais altos e melhores condições de trabalho. O presidente da Philadelphia and Reading Railroad Company e proprietário da mina, George Baer, não cedeu às exigências dos grevistas. Mitchell aproximou-se de Roosevelt e pediu-lhe que estabelecesse um conselho de arbitragem independente. Baer – e, ironicamente, os próprios mineiros – recusaram a arbitragem. Roosevelt, sob pressão dos republicanos e dos cidadãos americanos e sem sequer considerar a legalidade de suas ações, planejou substituir os grevistas por força com dez mil soldados do Exército e recomeçar a mineração de carvão se um acordo não pudesse ser alcançado. Felizmente, o Secretário de Guerra Elihu Root conseguiu evitar um desastre. Trabalhando com o banqueiro J.P. Morgan, Root conseguiu convencer os mineiros a aceitar uma arbitragem independente. Roosevelt ganhou a aprovação do povo americano, que lidou com a situação.
Também em 1902, o presidente Roosevelt chocou os financiadores na Rua Wall com sua decisão de aprovar o processo judicial do governo contra a Northern Securities, uma grande e recentemente fundida companhia ferroviária ocidental, por violar a Lei Sherman Anti-Trust. O J.P.Morgan, o financiador que tinha organizado a fusão e que tinha quantias significativas de dinheiro investido na Northern Securities, tomou a decisão de Roosevelt como um insulto pessoal. Muitos republicanos conservadores no Congresso e banqueiros em Wall Street atacaram o Presidente e o Procurador-Geral Philander Knox pela decisão. Para garantir a vitória do governo, Roosevelt também nomeou OliverWendell Holmes Jr., para substituir o juiz Horace Gray no Supremo Tribunal. Como presidente da Suprema Corte de Massachusetts, Holmes votou contra a indústria e as ferrovias em processos semelhantes, fazendo a escolha perfeita da perspectiva de Roosevelt. No final, o governo dos EUA ganhou o processo, a Northern Securities foi desmantelada em empresas menores e o presidente Roosevelt ficou conhecido como o “Trustbuster”
Como a Lei Sherman nunca havia sido verdadeiramente aplicada até então, a quebra da Northern Securities abriu a porta para processos contra outros grandes trusts. Famoso entre estes foi a “quebra” de Roosevelt do Standard Oil Trust. A história da Standard Oil de Muckraker Ida Tarbell, que foi publicada na revista McClure, detalhou as práticas comerciais da máquina petrolífera Rockefeller. A Tarbell acusou a Standard Oil de emitir descontos no total de um milhão de dólares aos seus clientes para eliminar eficazmente a concorrência. Em 1906, Roosevelt mandou elaborar e aprovar no Congresso o Projeto de Lei Hepburn para reformar as avaliações das taxas e proibir os descontos excessivos destinados a frustrar a concorrência. O projeto de lei também estipulava que todas as empresas envolvidas no comércio interestadual estavam sob a supervisão do governo federal. O projeto de lei prejudicou não apenas a Standard Oil, mas também as poderosas ferrovias emissoras de bônus. Ao todo, Roosevelt entrou com ações judiciais contra outros 43 trusts durante sua presidência.
Em 1907, os problemas financeiros atingiram os Estados Unidos quando a Knickerbocker Trust Company em Nova York falhou, levando a um efeito de cascata que fez com que muitos outros bancos também cambalearam. Roosevelt respondeu que foi a plutocracia que causou os problemas. Embora fosse impossível discernir a época, o resto do mundo também estava sofrendo, e o Panico de 1907 não foi nem o resultado das políticas de Roosevelt, nem das práticas comerciais dos plutocratas. Quando a grande corretagem de Moore e Schley quase entrou em colapso, J.P. Morgan reuniu-se mais uma vez com o presidente. Moore e Schley detinham cinco milhões de dólares em ações da Tennessee Coal and Iron Company que ela não podia converter em dinheiro para pagar seus investidores. A Morgan sugeriu que a U.S. Steel Company comprasse a Tennessee Coal and Iron Company, validando suas ações, e assim estabilizasse Moore e Schley. Este plano funcionaria desde que a Roosevelt aprovasse a fusão e prometesse não declará-la uma violação da Lei Sherman. Roosevelt consentiu, U.S. Steel comprou a Tennessee Coal and Iron, e como resultado, o mercado de ações não entrou em colapso. Juntos, Roosevelt e Morgan evitaram com sucesso uma depressão econômica generalizada.
O romance de 1906 de Upton Sinclair, The Jungle, que retratava graficamente as horríveis condições de trabalho dos estaleiros de Chicagostockyards e da indústria de empacotamento de carnes, estimulou Roosevelt a fazer outras reformas. O presidente ficou especialmente enojado com o relato de Sinclair, baseado em fatos, de um maquinista que caiu em um moedor de carne e surgiu como carne enlatada para ser vendida e comida. Roosevelt pediu ação imediata e organizou uma investigação sobre as empacotadoras em Chicago e em outras cidades. Um grito público indignado de ação rapidamente produziu o Meat Inspection Bill e mais tarde a criação da Food and Drug Administration.
Outro componente importante da política doméstica de Roosevelt foi a conservação, decorrente de seu grande amor ao ar livre.Depois de ter visitado a nação em várias viagens de campanha, incluindo pontos na Califórnia, no Noroeste do Pacífico e no Sudoeste, o presidente decidiu conservar o máximo de terra possível. A idéia de conservação de Roosevelt era inovadora – na época, a idéia de conservar a terra significava principalmente não a preservação, mas apenas salvar a terra para que as gerações futuras a utilizassem mais tarde. Durante suas administrações, Roosevelt comprou 150 acres de terra para conservar. Roosevelt também foi consorciado com muitos conservacionistas proeminentes da época, tais como GiffordPinchot e John Muir, e estabeleceu muitas conservações de vida selvagem junto com eles. O Serviço Florestal Nacional foi organizado e os Parques Nacionais Adicionais foram colocados de lado em todos os Estados Unidos para fins de criação e conservação. Tais atos enfrentaram a oposição de muitos membros do Congresso e colonos ocidentais que tinham planos de usar a terra que estava sendo reservada. Os colonos estavam, no entanto, satisfeitos com a Lei de Recuperação de 1902, que reservou dinheiro para irrigar – antes secas e sem vida – áreas de terra.