Mózg ma kilka form ochrony przed urazami. Pierwszą z nich jest czaszka, która składa się z grubej kości. Pomiędzy czaszką a samym mózgiem znajdują się trzy błony ochronne, opony mózgowe:
- Dura mater: gruba warstwa tkanki przymocowana do czaszki i tworząca arkusze między dwiema półkulami mózgowymi (falx cerebri) oraz między mózgiem a móżdżkiem (tentorium cerebelli).
- Materiał pajęczynówki: cieńsza warstwa (zwana pajęczynówką jak pajęczyna) oddzielona od opony twardej.
- Materiał pia: cienka warstwa ściśle przylegająca do samego mózgu.
Pomiędzy materią pajęczynówki a materią pia znajduje się przestrzeń zwana przestrzenią podpajęczynówkową. Przestrzeń ta jest wypełniona płynem zwanym płynem mózgowo-rdzeniowym (ang. cerebrospinal fluid, CSF). Stanowi on kolejną warstwę ochronną dla mózgu. Płyn mózgowo-rdzeniowy wypełnia również cztery dodatkowe przestrzenie zwane komorami.
Płyn mózgowo-rdzeniowy jest wytwarzany poprzez filtrowanie krwi przez sieć naczyń krwionośnych w komorach zwanych splotem naczyniówkowym. Płyn mózgowo-rdzeniowy jest wytwarzany w sposób ciągły; krąży on wokół mózgu i rdzenia kręgowego, a następnie odprowadzany jest z powrotem do krwiobiegu przez zgrubienia zwane kosmkami pajęczynówki, które wystają do dużych zatok żylnych (kanałów) w czaszce.
Gdy krążenie płynu mózgowo-rdzeniowego jest zablokowane, płyn gromadzi się wewnątrz czaszki, powodując wodogłowie.
.