Pili – plural for pilus – er hårlignende vedhæng, der findes på overfladen af mange bakterier. Pili er skrøbelige og skal konstant udskiftes.Pili (flertal) eller pilus (ental)er et biologisk molekyle, som findes på overfladen af mange bakterier. Det beskrives nogle gange som en hårstruktur. Udtrykket pilus kommer af det latinske ord tråd eller fiber. Alle pili består af oligomeriske proteiner. Pili bruges til forskellige formål i cellen. Den er fastgjort på cellens overflade for at overføre DNA fra celle til celle, for at hæfte sig til overflader og for generel celle-celleadhæsion. Der findes to forskellige former for pili. Korte og lange. De korte er meget talrige omkring cellen og hjælper cellerne med at kolonisere miljøets overflader og klæbe til andre celler. Dette hjælper også cellerne til at modstå en eventuel udskylning! De lange pili har noget at gøre med sex eller overførsel af DNA. Dette kaldes konjugationspili, fordi det hjælper med konjugation eller sex. Konjugation er den måde, hvorpå en celle overfører DNA til en anden ved kontakt med cellen. Pili har også betydning i forbindelse med bakterieinfektion. Pili’erne hjælper bakterierne med ikke at blive skyllet ud ved adhæsion, og derfor klæber de fast til celler og inficerer. Dette forårsager sygdom på grund af, at pili hjælper bakterierne med at binde sig til cellerne.