Cellulær
Destillationen begynder straks i mundhulen med både mekanisk og kemisk fordøjelse. Den mekaniske fordøjelse i mundhulen består i, at maden knuses i mindre stykker af tænderne, en proces, der kaldes mastication. Den kemiske fordøjelse i munden er mindre omfattende, men består af spyt-amylase (ptyalin eller alfa-amylase) og lingual lipase, som begge findes i spyttet. Spyt-amylase er kemisk identisk med amylase fra bugspytkirtlen og fordøjer stivelse til maltose og maltotriose ved en optimal pH-værdi på 6,7 til 7,0. Lingual lipase, som også findes i spyttet, hydrolyserer esterbindingerne i triglycerider til diacylglyceroler og monoacylglyceroler. Efter tilstrækkelig fordøjelse i mundhulen synkes det delvist fordøjede levnedsmiddel eller bolus ind i spiserøret. Der sker ingen fordøjelse i spiserøret.
Efter passage gennem spiserøret kommer bolussen ind i mavesækken og gennemgår mekanisk og kemisk fordøjelse. Den mekaniske fordøjelse i maven sker via peristaltiske sammentrækninger af den glatte muskulatur fra fundus mod den sammentrukne pylorus, kaldet propulsion. Når bolussen er i nærheden af pylorus, fungerer antrummet til at kværne materialet ved hjælp af kraftige peristaltiske sammentrækninger, der tvinger bolussen mod en stramt indsnævret pylorus. Antrums omrøring tjener til at reducere størrelsen af madpartiklerne og kaldes formaling. Kun partikler, der er mindre end 2 mm i diameter, kan passere gennem den sammentrukne pylorus ind i tolvfingertarmen. Resten af bolussen skubbes tilbage til mavesækken for yderligere mekanisk og kemisk fordøjelse. Denne bagudgående bevægelse af bolus fra pylorus til mavesækken kaldes retropulsion og tjener også til at hjælpe med den mekaniske fordøjelse. Denne sekvens af fremdrift, formaling og retropulsion gentages, indtil madpartiklerne er små nok til at passere gennem pylorus til tolvfingertarmen. Alt tykmælk, der ikke skubbes gennem pylorus under den aktive fordøjelsesproces, bliver til sidst skubbet ind i tolvfingertarmen gennem en afslappet pylorus ved en række kraftige peristaltiske sammentrækninger i maven. Denne aktivitet sker i den mellem fordøjelsesfasen kaldet migrerende motoriske komplekser (MMC’er), der fungerer til at flytte bolus på en aboral måde for at forhindre stagnation og bakterieophobning.
Der foregår en betydelig kemisk fordøjelse i mavesækken. Der findes to typer kirtler i maveslimhinden, som hjælper med den kemiske fordøjelse: oxyntiske kirtler og pyloriske kirtler. Oxyntiske kirtler er placeret i mavekroppen og indeholder parietalceller og høvdingeceller. Parietalcellerne udskiller saltsyre, der er koncentreret til ca. 160 mmol/L og har en pH-værdi på 0,8. Den saltsyre, der udskilles af parietalcellerne, tjener tre hovedfunktioner: 1) at skabe et fjendtligt miljø for patogene mikroorganismer, der optages gennem munden, 2) at denaturere proteiner og gøre dem mere tilgængelige for enzymatisk nedbrydning af pepsin, og 3) at aktivere zymogenet pepsinogen til dets aktive form, pepsin. Parietalcellerne udskiller også et stof kaldet intrinsisk faktor, som er nødvendigt for absorptionen af vitamin B12 i det terminale ileum. Oxyntiske kirtler indeholder også chefceller, der udskiller zymogenet pepsinogen. Pepsinogen er forstadiet til det proteolytiske enzym pepsin og skal aktiveres til pepsin af mavens sure pH-værdi (under 3,5) eller ved autoaktivering af pepsin selv. Pepsin vil derefter virke på de indre peptidbindinger i proteiner ved en optimal pH-værdi på 2 til 3. Pylorus-kirtlerne findes i mavesækkens antrum og indeholder slimhindeceller og G-celler. Slimhindecellerne udskiller en bikarbonatrig slimhinde på overfladen af maveslimhinden for at beskytte den mod mavesækkens sure indhold. G-cellerne udskiller gastrin, et hormon, der virker endokrin for at stimulere parietalcellernes sekretion af saltsyre. Der sker ingen fordøjelse af kulhydrater i mavesækken.
Den største del af den kemiske fordøjelse sker i tyndtarmen. Fordøjet chyme fra mavesækken passerer gennem pylorus og ind i duodenum. Her blandes chymus med sekreter fra både bugspytkirtlen og tolvfingertarmen. Mekanisk fordøjelse vil også stadig finde sted i mindre omfang. Bugspytkirtlen producerer mange fordøjelsesenzymer, herunder pancreatisk amylase, pancreatisk lipase, trypsinogen, chymotrypsinogen, procarboxypeptidase og proelastase. Disse enzymer er adskilt fra det sure miljø i maven og fungerer optimalt i det mere basiske miljø i tyndtarmen, hvor pH-værdien ligger mellem 6 og 7 på grund af det bikarbonat, der udskilles af bugspytkirtlen. Amylase fra bugspytkirtlen fungerer ligesom spyt-amylase til at nedbryde stivelse til maltose og maltotriose. Pancreaslipase, der udskilles af bugspytkirtlen sammen med et vigtigt coenzym kaldet colipase, fungerer til at hydrolyserer esterbindingerne i triglycerider til diacylglyceroler og monoacylglyceroler. Trypsinogen, chymotrypsinogen, procarboxypeptidase og proelastase er alle forløbere for aktive peptidaser. Pancreas udskiller ikke den aktive form af peptidaserne, da der ellers kunne forekomme autodigestion, som det er tilfældet ved pancreatitis. I stedet omdannes trypsinogen, chymotrypsinogen, procarboxypeptidase og proelastase til henholdsvis trypsin, chymotrypsin, carboxypeptidase og elastase. Denne omdannelse sker i takt med, at enterokinase, et duodenalt enzym, omdanner trypsinogen til trypsin. Trypsin kan derefter omdanne chymotrypsinogen, procarboxypeptidase og proelastase til deres aktive former. Trypsin, chymotrypsin og elastase er alle endopeptidaser, der hydrolyserer indre peptidbindinger i proteiner, mens carboxypeptidaserne er exopeptidaser, der hydrolyserer terminale peptidbindinger på proteiner. Disse pancreatiske zymogener forlader pancreas gennem hovedpancreasgangen (Wirsung) og går sammen med den almindelige galdegang og danner Vaderampullen og tømmes ud i den nedadgående del af duodenum via den store duodenale papil. Den almindelige galdegang transporterer galde, der er dannet i leveren og opbevaret i galdeblæren. Galde indeholder en blanding af galdesalte, kolesterol, fedtsyrer, bilirubin og elektrolytter, der hjælper med at emulgere hydrofobiske lipider i tyndtarmen, hvilket er nødvendigt for adgang og virkning af pancreaslipase, som er hydrofil.
Når den først er i duodenum, vil der være en aktiveringskaskade, der begynder med enterokinase produceret af duodenum for at aktivere trypsinogen til trypsin, og trypsin vil aktivere de andre pancreatiske peptidaser. Det er vigtigt, at duodenum også bidrager med flere fordøjelsesenzymer som f.eks. disaccharidaser og dipeptidaser. Disaccharidaserne omfatter maltase, laktase og sucrase. Maltase spalter den glykosidiske binding i maltose, hvorved der dannes to glukosemonomerer, laktase spalter den glykosidiske binding i laktose, hvorved der dannes glukose og galaktose, og sucrase spalter den glykosidiske binding i saccharose, hvorved der dannes glukose og fruktose. Dipeptidase spalter peptidbindingen i dipeptider. På dette tidspunkt har munden, maven og tyndtarmen nedbrudt fedt i form af triglycerider til fedtsyrer og monoacylglycerol, kulhydrat i form af stivelse og disaccharider til monosaccharider og store proteiner til aminosyrer og oligopeptider. Fordøjelsesprocessen har således omdannet makronæringsstoffer til former, der kan optages i blodbanen til kropslig brug.