Tidlig trænerkarriereRediger
Huggins begyndte sin trænerkarriere som graduate assistant hos West Virginia under Gardner i 1977. Han tilbragte derefter to år som assistent for Eldon Miller på Ohio State University. Huggins var kun 27 år, da han blev college-cheftræner på Walsh University i 1980. I tre sæsoner hos Walsh opnåede han et resultat på 71-26 og blev to gange kåret som årets træner i NAIA District 22. Huggins førte Walsh-holdet i 1982-83 til et perfekt resultat på 30-0 i den regulære sæson og et slutresultat på 34-1. Efter at have været assistent på University of Central Florida i sæsonen 1983-84 blev Huggins udnævnt til cheftræner for University of Akron. Huggins opnåede et resultat på 97-46 og spillede efter sæsonen i tre af sine fem sæsoner i Akron, herunder et NCAA-bud i 1985-86-sæsonen.
CincinnatiRediger
Cincinnati havde en rig historie, men var gået ned ad bakke. Cincinnati optrådte i 5 på hinanden følgende Final Fours fra 1959 til 1963 – og vandt det nationale mesterskab i 1961 og 1962. I 1989, da Huggins blev ansat, havde Bearcats imidlertid ikke fået et bud på en plads i NCAA-turneringen siden 1977. Endnu værre var det, at Cincinnati kun havde en enkelt vinder i de 12 foregående sæsoner. Bearcats blev inviteret til NIT i hans to første år og nåede derefter helt frem til Final Four i NCAA-turneringen i 1992, Huggins’ tredje sæson som træner.
Huggins opnåede i alt en rekord på 399-127 (.759) i sine 16 år i Cincinnati, hvilket gør ham til den mest vindende basketballtræner i skolens historie. Huggins førte Cincinnati til ti titler i konferencen i den regulære sæson og otte titler i ligaens turnering. Bearcats deltog i post-season play i hver af Huggins’ 16 sæsoner. Ud over den førnævnte Final Four-deltagelse i 1992 nåede de frem til Elite Eight i NCAA-turneringen to andre gange, i 1993 og 1996.
Huggins modtog Ray Meyer-prisen som årets træner i Conference USA hele tre gange (1997-98, 1998-99 og 1999-2000) og blev enstemmigt valgt som Årtiets træner i CUSA. Han blev valgt til årets træner på nationalt plan af ESPN.com i 2001-02. Hans hold vandt fem konferenceturneringstitler i træk – alle fire Great Midwest Conference-titler fra 1992 til 1995 og den første Conference USA Men’s Basketball Tournament i 1996. Han blev udnævnt til årets medlandstræner af The Sporting News og blev årets landstræner af Basketball Times i 1997-98. Han fik anerkendelse som årets nationale træner af Hoop Scoop i 1991-92 og Playboy i 1992-93.
I løbet af sin tid trænede Huggins tre All-Americans: Danny Fortson, Kenyon Martin (årets konsensusspiller i 1999-2000) og Steve Logan.
I 1997-98 førte Huggins et hold, som kun havde én tilbagevendende starter, til et resultat på 27-6, Conference USA-titler i den ordinære sæson og turnering, en 2. plads i NCAA-turneringen og en top-10-placering i meningsmålingerne. Holdet blev derefter slået i ottendedelsfinalen af West Virginia i NCAA-turneringen. Huggins’ hold i 2001-02, der ikke var rangeret, da sæsonen begyndte, opnåede en rekord på 31-4, satte skolens rekord i antal sejre, vandt Conference USA’s regulære sæson og turneringstitler og blev nr. 1 i NCAA-turneringen, hvor de tabte i dobbelt overtid til nr. 8, UCLA, i anden runde. I 2002-03 blev Huggins ramt af et alvorligt hjerteanfald den sidste lørdag i september, men var til stede til holdets første træning to uger senere. Holdet kvalificerede sig til NCAA-turneringen som 8-seedede og blev slået ud i første runde af Gonzaga.
I 2003-04 førte Huggins Bearcats til titler i den ordinære sæson og turnering og en plads i NCAA-turneringen, mens de opnåede et resultat på 25-7. Trods en gunstig lodtrækning – holdet blev sendt til det nærliggende Columbus i de to første runder af turneringen – blev Bearcats besejret af Illinois Fighting Illini i anden runde, hvor de tabte med 24 point. Bearcats 2004-05 opnåede et resultat på 25-8, hvilket var den niende sæson i de foregående 10 sæsoner, hvor Bearcats havde vundet mindst 25 kampe. De fik en 7. seedning i turneringen og tabte til den senere Elite Eight-deltager Kentucky i anden runde i RCA Dome i det nærliggende Indianapolis.
FratrædelseRediger
Den 23. august 2005 gav UC’s præsident Nancy L. Zimpher Huggins et ultimatum: han skulle fratræde og tage imod en udtrædelse på 3 millioner dollars eller blive omplaceret uden for sportsafdelingen i resten af sin kontrakt. Hvis Huggins ikke havde reageret inden for 24 timer, ville han være blevet fyret. Huggins havde usandt fortalt pressen, at han ikke kendte til ultimatummet, før adskillige journalister ringede til ham i Las Vegas. Flere korrespondancer mellem UC og Huggins’ advokat viste imidlertid, at parterne ikke blot havde forhandlet om hans opsigelse, men at Huggins flere uger i forvejen vidste, at hans opsigelse var nært forestående. Han gik i sidste ende med til at acceptere udbetalingen på 3 millioner dollars.
Zimpher sagde, at Bearcat-programmet under Huggins ikke passede ind i hendes plan om at opgradere UC’s akademiske omdømme. Hun havde dog seriøst overvejet at afsætte Huggins, siden han blev arresteret for spirituskørsel i 2004. Ifølge Wall Street Journal var Zimpher særligt oprørt over, at nyheden om anholdelsen kom frem om morgenen på hendes første dimission som UC’s præsident, hvor Coretta Scott King skulle være taler, og hvor det var meningen, at Coretta Scott King skulle være taler. Huggins hjalp ikke på sit image hos Zimpher, da en assistenttræner, to spillere og en rekrut blev anholdt i foråret 2005.
På det tidspunkt havde Huggins’ kontrakt en rollover-klausul, der tilføjede et år hver sommer. Zimpher tilbagekaldte denne klausul den 11. juni 2004 efter at han havde erklæret sig ubestridt, men tillod Huggins at vende tilbage til basketballsæsonen 2004-05. Den 11. maj 2005 fik han mulighed for at forlade eller afslutte de sidste to år, der var tilbage af hans kontrakt. På en pressekonference den 16. maj 2005 meddelte Huggins, at han blev, indtil hans kontrakt udløb den 30. juni 2007, hvorved han accepterede de vilkår, som UC oprindeligt tilbød ham.
Huggins blev erstattet af den assisterende cheftræner Andy Kennedy.
Kansas StateRediger
Efter at have tilbragt et år uden for trænergerningen accepterede Huggins den 23. marts 2006 jobbet som cheftræner på Kansas State University, hvor han erstattede den fyrede Jim Wooldridge. Wildcats havde ikke været med i NCAA-turneringen siden 1995-1996-kampagnen og havde ikke haft en konferencerekord bedre end 7-9, siden Big 12-konferencen blev dannet i 1996. De tre tidligere Kansas State-basketballtrænere (Dana Altman, Tom Asbury og Wooldridge) havde tilsammen opnået et resultat på 236-232 (.504). I sin eneste sæson i Kansas State trænede Huggins Wildcats til et samlet resultat på 23-12 og et resultat på 10-6 i Big 12. Wildcats blev ikke inviteret til NCAA-turneringen, men accepterede et NIT-bud og vandt en kamp, inden de tabte i anden runde.
Nogle af Huggins’ rekrutteringsmål omfattede konsensus top 10-spillere i O. J. Mayo, Bill Walker, samt konsensus top 100-rekrutter som Herb Pope, Ramar Smith og Jason Bennett. Mens Mayo, Pope og Smith alle endte på andre skoler, var Huggins i stand til at hente Bennett til 2006-07-sæsonen, og Walker – som oprindeligt var planlagt til at slutte sig til holdet i 2007-08-sæsonen – formåede at blive færdiguddannet fra North College Hill High School før tid for at kunne deltage i tide til forårssemestret. Huggins’ anden rekrutteringsklasse blev vurderet endnu bedre. Den vigtigste rekruttering var den konsensus top 5-spiller Michael Beasley fra Washington, D.C.-området. Andre rekrutter i 2007-klassen omfattede Walker, Dominique Sutton – en 6’4″ swingman fra Durham, North Carolina – Jacob Pullen – en 6’1″ point guard fra Proviso East High School – og Fred Brown, en 6’2″ shooting guard fra West Palm Beach, Florida.
Ud over Huggins’ rekrutter havde Kansas State fået fire af sine fem bedste scorere tilbage, herunder Cartier Martin fra 2. hold i All-Big 12-konferencen og David Hoskins fra Honorable All-Big 12-konferencen. 2005-06-holdet havde været involveret i mange tætte kampe og gik 7-9 i kampe, der blev afgjort med 5 point eller mindre i løbet af sæsonen. Wildcats blev valgt til at slutte så højt som på 5. pladsen i Big 12,. Før den sæson var Kansas State aldrig endt højere end på en 7. plads i Big 12. Den tidlige del af sæsonen fik en uheldig start, da Wildcats startede året 4-3, hvilket omfattede tab til New Mexico Lobos og California Golden Bears med tilsammen 54 point. Wildcats ville i sidste ende drage fordel af Bill Walkers valgbarhed og vandt seks kampe i træk, herunder en turneringssejr i Las Vegas Holiday Classic. Wildcats ramte dog snart en ny hård periode, da de tabte tre kampe i træk til Xavier, Texas A-7002>M og Texas Tech. Endnu mere skadeligt var tabet af stjernefrøken Bill Walker, da han rev sit korsbånd over fem minutter inde i et 69-65-nederlag til Texas A&M. Efter Walker-skaden styrkede seniorerne Martin, Lance Harris og Akeem Wright deres spil og førte Kansas State til en sejrsstime på 7 kampe, som omfattede en sejr over de rangerede Texas Longhorns i Austin, der brød en 22-spilers sejrsstime på Texas’ hjemmebane. I anden halvdel af Big 12-spillet blev Wildcats 4-4, herunder et par nederlag til deres rivaler i samme stat, Kansas Jayhawks. Kansas State sluttede Big 12-sæsonen i semifinalen i Big 12-turneringen ved at tabe til Kansas for tredje gang, men vandt dog en afgørende 66-45 sejr over Texas Tech. Wildcats fik et NIT-bud og spillede 1-1 ved at slå Vermont og tabe til DePaul. Kansas State sluttede sæsonen 23-12 (10-6)-det højeste antal sejre for et Wildcat-hold siden 1987-1988, et år, hvor de tabte til Kansas Jayhawks i Elite Eight i NCAA-turneringen i 1988.
West VirginiaRediger
Den 5. april 2007 meddelte Huggins, at han havde accepteret stillingen som cheftræner på sin alma mater, West Virginia University. Huggins afløste John Beilein, der forlod klubben for at besætte samme stilling hos Michigan Wolverines.Kun ni kampe inde i sæsonen 2007-2008 kom Mountaineers ind i AP Top 25-puljen med en placering som nr. 24 med en 8-1-rekord. Den 22. december 2007 opnåede Huggins sin 600. sejr som cheftræner i en udekamp på Canisius.
Mountaineers afsluttede den regulære sæson med en 83-74 sejr i overtid over St. John’s og åbnede derefter Big East Tournament med en 58-53 sejr over Providence. I anden runde af turneringen besejrede Mountaineers de nummer 15-rangerede Connecticut Huskies med 78-72. Joe Alexander bidrog med 34 point og 7 rebounds, hvilket er et højdepunkt i karrieren. Mountaineers tabte derefter til Georgetown Hoyas, nr. 9, med 55-72 i turneringens semifinale.
WVU’s præstation i Big East-turneringen bragte dem ind i den vestlige region i NCAA-turneringen som nr. 7-seedede. Mountaineers besejrede Arizona i første runde med 75-65 og besejrede nummer 2, Duke, med 73-67 for at komme i Sweet Sixteen, hvilket gav Huggins sin første Sweet Sixteen-deltagelse siden 2001, da han var træner i Cincinnati. I Sweet 16-kampen mod Xavier, der var nr. 3, kom Mountaineers tilbage fra et 18-punktsunderskud tidligt i kampen og fik udlignet 64-64 og sendt kampen i overtid. Xavier Musketeers hev dog sejren hjem med 79-75 med to 3-punktskast i kampens sidste 1:18 minut af kampen. West Virginia sluttede sæsonen som nr. 17 i AP poll.
I slutningen af sæsonen underskrev Huggins en 11-årig kontraktforlængelse, som ville holde ham som træner i West Virginia indtil han fyldte 65 år.
Den 18. maj fuldendte Huggins sin rekrutteringsklasse med underskrivelsen af small forward, Devin Ebanks. Den nr. 13-rangerede kandidat havde underskrevet med Indiana, før han afmeldte sig og kiggede på Memphis, Texas, Rutgers og WVU. Ebanks var den sidste tilføjelse til en nybegynderklasse, der omfattede #11-power forward Kevin Jones, #34-power forward Roscoe Davis og #26-point guard Darryl Bryant.
West Virginia begyndte sæsonen 2008-09 med 4-0, anført af senior Alex Ruoff, junior Da’Sean Butler og en nybegynderklasse med Devin Ebanks og Darryl Bryant i spidsen. De tabte Las Vegas Invitational Tournament Championship Game til Kentucky 54-43, men kom derefter tilbage med to sejre og kom op på 6-1. De tabte dog en kamp i sidste sekund til nr. 22 Davidson og Stephen Curry i Madison Square Garden med 68-65.
Efter dette nederlag vandt WVU fem sejre i træk, herunder en sejr på 76-48 over nr. 13 Ohio State i Columbus, hvilket brød Buckeyes’ sejrsstime på 14 kampe og gav OSU deres største nederlag på hjemmebane siden 1998. Denne stime sluttede dog med et nederlag på 61-55 til nr. 5 Connecticut, som blev efterfulgt af et nederlag på 75-53 til nr. 15 Marquette. Mountaineers kom tilbage med en sejrsstime på tre kampe, som omfattede en sejr på 75-58 over #14 Georgetown i Washington, D.C. Sejren sluttede med et nederlag på 79-67 til #4 Pittsburgh i Backyard Brawl. WVU besejrede St. John’s, men tabte derefter til Louisville nr. 7 og Syracuse nr. 20 i træk. Mountaineers afsluttede nederlagssrækken med en 86-59 sejr over Providence, men tabte derefter til Pitt for anden gang.
West Virginia fulgte tabet til Pitt op med en 93-72 sejr over Villanova nr. 13 med Da’Sean Butlers karrieremæssigt rekordstærke præstation på 43 point. Mountaineers besejrede derefter Notre Dame men’s basketball og Rutgers, inden de tabte til Cincinnati med 70-59 i Huggins’ hjemkomst til Cincinnati. Mountaineers kom tilbage med sejre i træk mod USF og DePaul, men tabte til #6 Louisville 62-59 i Morgantown, mens de var værter for College GameDay.
West Virginia fik en første runde i Big East Tournament 2009 og åbnede anden runde af spillet med en 74-62 sejr over Notre Dame. I kvartfinalerunden besejrede West Virginia nr. 2 Pittsburgh med 74-60. Holdet den semifinale kampen til Syracuse i overtid 74-69. Syracuse var frisk fra en sejr på seks gange overtid mod Connecticut, den længste kamp i Big East-historien. WVU fik en 6. seedning i NCAA-turneringen og spillede deres kamp i første runde mod de 11. seedede Dayton Flyers. Sæsonen sluttede med et nederlag på 68-60 til Flyers.
West Virginia havde et fantastisk år og vandt 31 kampe, hvilket er skolens rekord. WVU vandt den tidlige sæson 76 Classic og besejrede Long Beach State i kvartfinalen, Texas A&M i semifinalen og Portland i mesterskabsrunden. Mountaineers besejrede syv NCAA-turneringshold i løbet af sæsonen, herunder sejre uden for turneringen over førnævnte Texas A&M og Ohio State. Huggins’ Mountaineers delte den årlige Backyard Brawl med Pitt, hvor hvert hold vandt på deres hjemmebane. WVU sluttede den regulære sæson med en 24-6 (13-5) sejr, hvilket var godt for andenpladsen i Big East, efter Syracuse. Dette er WVU’s højeste placering i den regulære sæson i deres tid i Big East. Mountaineers fik dobbelt adgang til kvartfinalen i Big East-turneringen. WVU besejrede efterfølgende Cincinnati, Notre Dame i semifinalen og Georgetown Hoyas i mesterskabsspillet for at vinde deres første Big East Tournament-titel.
WVU fik en 2. seedning (deres højeste nogensinde) i NCAA Tournament i East Region. Huggins’ hold besejrede #15 seedede Morgan State i deres kamp i første runde, #10 seedede Missouri i anden runde og #11 seedede Washington Huskies i Sweet 16-runden. Dermed var der lagt op til et Elite Eight-møde mellem Mountaineers og de 1. seedede Kentucky Wildcats, der trænes af Huggins’ mangeårige ven, John Calipari. I en hård kamp, der bølgede frem og tilbage, vandt WVU i sidste ende en sejr på 73-66, som sendte Mountaineers til deres anden Final Four i skolens historie.
Den 3. april 2010 mødtes Duke, den sydlige seedede nr. 1, og Mountaineers i den anden af Final Four-kampene. Duke viste sit fulde potentiale i kampen og ramte 52,7 procent af sine skud (og 52 procent af sine trepointere), mens West Virginias 1-3-1 zonefælde blev ødelagt. Duke førte 39-31 ved halvlegen og fastholdt sit glødende skudniveau i anden halvleg. Efter at WVU mistede stjerneforward Da’Sean Butler, der er finalist til Wooden Award, på grund af en ødelæggende knæskade, kom kampens afgørende spil, da Nolan Smith missede et omstridt fast-break layup, men Kyle Singler og Miles Plumlee kombinerede sig til at smække reboundet hjem og give Duke en føring på 14 point. På trods af Final Four-nederlaget afsluttede WVU sæsonen med en 31-7-rekord og blev nr. 3 i den endelige Coaches’ Poll og nr. 6 i AP Poll.
Den 22. december 2011 opnåede Huggins sin 700. sejr i karrieren ved at besejre Missouri State, hvilket gør ham til en af 4 aktive trænere i Division I college basketball, der har opnået mere end 700 sejre.
Efter to skuffende sæsoner, hvor WVU i den ene sæson slet ikke kom med i eftersæsonen, og den anden endte med et nederlag i første runde af NIT, kom Huggins og Mountaineers tilbage i 2014-15 og nåede frem til Sweet Sixteen, inden de måtte bøje sig mod Kentucky, som var nummer 1 i den samlede seedning og ubesejret på det tidspunkt.
I 2015-16 fik holdet en 15-1-start, herunder en 4-0-markering i Big 12, og klatrede så højt som til nr. 6 i AP Poll efter en sejr over Kansas som nr. 1. Mountaineers var rangeret i de sidste 16 uger i AP poll. Mountaineers blev nummer to efter Jayhawks i Big 12 og nåede frem til mesterskabsspillet i Big 12-turneringen, inden de tabte til KU. I NCAA-turneringen i 2016 blev West Virginia tildelt en 3. seedning, men opholdet blev kortvarigt, da de blev slået ud af de 14. seedede Stephen F. Austin Lumberjacks i første runde.