Na domácí frontě byl prezident Roosevelt jedním z nejviditelnějších pokrokářů své doby. Mnohé z jeho domácíchpolitik se týkaly boje proti velkému průmyslu a korupci ve snaze pomoci obyčejným lidem. Nabídl Američanům SquareDeal, aby zlepšili svou životní úroveň a měli větší kontrolu nad velkými dominantními korporacemi nebo trusty. Trusty, které byly podle Shermanova zákona z roku 1890 technicky nezákonné, se pokoušely konsolidovat podnikatelské zájmy s cílem vytvořit monopol na určité výrobky a eliminovat konkurenci. Mnoho podnikatelů napadalo Roosevelta jako socialistu,ale on tato obvinění horlivě odmítal a vyvracel zásady marxismu. Ve skutečnosti Roosevelt velkými podniky nepohrdal a ve skutečnosti si uvědomoval, že trusty nepřímo zvýšily životní úroveň téměř každého Američana v druhé polovině 19. století. Rooseveltovi se však nelíbila moc trustů a skutečnost, že americká veřejnost nad nimi měla jen malou kontrolu. na druhou stranu se však také obával, že dá práci příliš velkou moc. Jeho politika Square Deal se snažila najít rovnováhu mezi oběma.
Rooseveltova první velká domácí zkouška ve funkci prezidenta přišla, když 140 000 horníků ve východní Pensylvánii vstoupilo do stávky v rámci uhelné stávky v roce1902. Uhlí bylo v této době životně důležitým zdrojem energie pro téměř všechny Američany a národ během stávky propadl panice. horníci, zastupovaní Johnem Mitchellem, založili odborovou organizaci United MineWorkers Union, aby požadovali vyšší mzdy a lepší pracovní podmínky. Prezident železniční společnosti Philadelphia and Reading Railroad Company a majitel dolu George Baer nechtěl požadavkům stávkujících ustoupit. Mitchell se obrátil na Roosevelta a požádal ho o zřízení nezávislé rozhodčí rady. Baer – a paradoxně i samotní horníci – arbitráž odmítli. Roosevelt pod tlakem republikánů a amerických občanů a bez ohledu na legálnost svého jednání plánoval nahradit stávkující silou deseti tisíc vojáků a začít znovu těžit uhlí, pokud se nepodaří dosáhnout dohody. Ministr války Elihu Root naštěstí dokázal katastrofu odvrátit. Ve spolupráci s bankéřem J. P. Morganem se Rootovi podařilo přesvědčit horníky, aby přijali nezávislou arbitráž. Roosevelt získal souhlas Američanů se způsobem, jakým situaci řešil.
V roce 1902 prezident Roosevelt také šokoval finančníky na Wall Street svým rozhodnutím schválit vládní žalobu proti Northern Securities, velké a nedávno sloučené západní železniční společnosti, za porušení Shermanova antimonopolního zákona. J. P. Morgan, finančník, který fúzi zařídil a který měl v Northern Securities investovány značné finanční prostředky, bral Rooseveltovo rozhodnutí jako osobní urážku. Mnoho konzervativních republikánů v Kongresu a bankéřů na Wall Street napadlo za toto rozhodnutí prezidenta a generálního prokurátora Philandera Knoxe. Američané naopak Roosevelta za jeho odvahu tváří v tvář trustům milovali.Aby zajistil vítězství vlády, jmenoval Roosevelt také OliveraWendella Holmese mladšího na místo soudce Horace Graye v Nejvyšším soudu. Jako předseda Nejvyššího soudu v Massachusetts hlasoval Holmes v podobných žalobách proti průmyslu a železnicím, což z Rooseveltova pohledu představovalo ideální volbu. Vláda Spojených států nakonec žalobu vyhrála, Northern Securities se rozpadla na menší společnosti a prezident Roosevelt se stal známým jako „Trustbuster“.
Jelikož Shermanův zákon nebyl do té doby nikdy skutečně prosazován, rozpad Northern Securities otevřel bránu pro žaloby na další velké trusty. Známý byl Rooseveltův „zásah“ proti trustu Standard Oil. Muckrakerka Ida Tarbellová v knize History of Standard Oil, která byla publikována v časopise McClure, podrobně popsala obchodní praktiky Rockefellerovy ropné mašinérie. Tarbellová obvinila společnost Standard Oil z toho, že svým zákazníkům poskytovala slevy v celkové výši jednoho milionu dolarů, aby účinně eliminovala konkurenci. V roce 1906 nechal Roosevelt vypracovat a Kongresem schválit Hepburnův zákon, který měl reformovat vyhodnocování sazeb a zakázat nadměrné slevy určené k maření konkurence. Návrh zákona rovněž stanovil, že všechny společnosti zapojené do mezistátního obchodu podléhají dohledu federální vlády. Návrh zákona poškodil nejen Standard Oil, ale i silné železnice, které poskytovaly slevy. Celkem Roosevelt během svého prezidentství podal žaloby proti třiačtyřiceti dalším trustům.
V roce 1907 zasáhly Spojené státy finanční potíže, když zkrachovala Knickerbocker Trust Company v New Yorku, což vedlo ke kaskádovému efektu, který způsobil krach i mnoha dalších bank.Konzervativní republikáni obviňovali Roosevelta z hospodářských potíží a tvrdili, že jeho kroky podkopaly stabilitu a narušily důvěru spotřebitelů. Roosevelt opáčil, že potíže způsobila plutokracie. Ačkoli to v té době nebylo možné rozpoznat, zbytek světa trpěl také a panika roku 1907 nebyla ani důsledkem Rooseveltovy politiky, ani obchodních praktik plutokratů. Když se málem zhroutila velká makléřská společnostMoore and Schley, J. P. Morgan se opět sešel s prezidentem. Moore a Schley drželi akcie společnosti Tennessee Coal and Iron Company v hodnotě pěti milionů dolarů, které nemohli přeměnit na hotovost, aby vyplatili své investory. Morgan navrhl, aby finančně zdravá společnost U.S. Steel Company koupila společnost Tennessee Coal and Iron Company, potvrdila platnost jejích akcií a tím stabilizovala společnost Moore and Schley. Tento plán by fungoval, pokud by Roosevelt fúzi schválil a slíbil, že ji neprohlásí za porušení Shermanova zákona. Roosevelt souhlasil,U.S. Steel koupila Tennessee Coal and Iron, a díky tomu se akciový trh nezhroutil. Společně se Roosevelt a Morgan úspěšně vyhnuli rozsáhlé hospodářské depresi.
Román Uptona Sinclaira Džungle z roku 1906, který obrazově vylíčil hrozné pracovní podmínky v chicagských dvorech a masokombinátech, podnítil Roosevelta k dalším reformám. Prezidenta znechutil zejména Sinclairův zjevně na faktech založený příběh strojníka, který spadl do mlýnku na maso a vynořil se z něj jako masová konzerva určená k prodeji a konzumaci. Roosevelt vyzval k okamžité akci a zorganizoval vyšetřování v balírnách v Chicagu a dalších městech. Ukázalo se, že podrobnosti této zprávy nejsou daleko od Sinclairova fiktivního vyprávění. rozhořčené volání veřejnosti po akci rychle vyústilo v zákon o kontrole masa a později ve vytvoření Úřadu pro potraviny a léčiva.
Další významnou součástí Rooseveltovy domácí politiky byla ochrana přírody, která vycházela z jeho velké lásky k přírodě.Poté, co prezident objel zemi na několika předvolebních cestách, včetně pobytů v Kalifornii, na severozápadě Tichého oceánu a na jihozápadě, se rozhodl zachovat co nejvíce půdy. rooseveltova myšlenka ochrany přírody byla průlomová – v té době myšlenka ochrany přírody neznamenala především zachování, ale pouze uchování půdy pro pozdější využití budoucími generacemi. z tohoto důvodu tvořily většinu chráněné půdy v té době lesy, které poskytovaly cenné dřevo. Roosevelt během své vlády zakoupil 150 akrů půdy určené k ochraně. Roosevelt se také stýkal s mnoha významnými ochránci přírody té doby, jako byli GiffordPinchot a John Muir, a spolu s nimi založil mnoho rezervací divoké přírody. Byla zřízena Národní lesní služba a po celých Spojených státech byly zřízeny další národní parky pro účely rekreace a ochrany přírody. Tyto akty se setkaly s odporem mnoha členů Kongresu a západních osadníků, kteří měli v plánu využívat vyčleněnou půdu. Osadníci však byli spokojeni s rekultivačním zákonem z roku 1902, který vyčlenil peníze na zavlažování dříve suchých a neobyvatelných pozemků.
.