Den viktigaste strömmen i södra Stilla havet är Humboldtströmmen (uppkallad efter den tyske naturforskaren Alexander von Humboldt, som upptäckte och studerade den), även känd som Perus ström, den följer Sydamerikas kust från Valdívia (en stad i södra Chile) till Cape Branco och fortsätter norrut. Den hålls uppe av de ständigt blåande vindarna från söder och sydost, som blåser på den sydamerikanska kusten och orsakar en skillnad i havsvattennivån. Det viktigaste kännetecknet för denna ström är den låga temperaturen, mellan 15 ºC och 19 ºC, på grund av uppströmningen av kallt vatten från havsbottnen, det är också en ström med låg salthalt och dess gröna färg står i kontrast till det blåa omgivande vattnet. Den har ett stort inflytande på vädret i norra Chile och södra Peru, den låga temperaturen i strömmen minskar nederbörden i dessa områden, vilket gör dem torra. Ibland, under sommaren, avbryts Humboldtströmmen i sitt norra dike av en ström som går söderut och följer Perus kust fram till 15º latitud söderut. Denna ström kallas El Niño och får det kalla vattnet vid kusten att tillfälligt försvinna, vilket ger upphov till kraftiga regn i Peru. I närheten av ekvatorn drar vattnet från Humboldtströmmen västerut och blandas med vattnet från den sydliga ekvatorialströmmen som går genom Stilla havet upp till Asien. En gren av den varma strömmen går söderut och passerar nära kusten i östra Australien (där den blir Australienströmmen) och blandar sig i södra Stilla havet med den kalla antarktiska strömmen.