ADVERTISERINGAR:
Låt oss göra en djupgående studie av ribosomernas roll i proteinsyntesen.
Ribosomer utgör den ram på vilken proteinsyntesen äger rum. Det mRNA binder till ribosomens 30S-underenhet för att bilda initieringskomplex. Ribosomens viktigaste roll är dess förmåga att katalysera bildandet av peptidbindningar mellan aminosyror, så att aminosyrorna införlivas i proteiner.
Ribosomer är täta granuler utan täckmembran. De observerades först av Palade. Bakteriella ribosomer innehåller 65 % RNA (rRNA) och 35 % proteiner. De har en diameter på 18 nm. Ribosomer finns i alla celler. E. coli har 10 000 ribosomer och utgör cirka 25 % av bakteriecellens totala massa. En däggdjurscell innehåller cirka 10 miljoner ribosomer.
ÅTERKÄNNANDE:
En ribosom har två underenheter:
Varje ribosom har två ojämna underenheter, en stor och en liten underenhet. Bakteriernas ribosomer består av två underenheter 30S och 50S sedimentationskoefficient i sackaros. De har en kombinerad sedimentationskoefficient på 70S. Båda underenheterna innehåller många proteiner och minst ett stort rRNA.
Eukaryotiska ribosomer är större än bakteriella ribosomer. De har två ojämna underenheter 40S och 60S som har en kombinerad sedimentationskoefficient på 80S. Ribosomer mäts i termer av deras sedimentationshastighet mätt i Svedberg-enheter (S). IS = 10~13 sekund. Alla ribosomer i en viss cell är identiska. Ribosomens beståndsdelar kan separeras och återförenas spontant. En ribosom har en kärna av rRNA och proteiner som är fästade på ytan.
I prokaryoter har både 30S- och 50S-underenheterna rRNA- och proteinmolekylkomponenter.
Samma sak gäller för eukaryotiska ribosomer som har följande komponenter:
40S-underenhet: 18S-molekyl + 30 proteiner
60S-underenhet: 5S, 5.8S och rRNA + 50 proteiner.
Den 70S ribosomens struktur är inte symmetrisk. 70S ribosomen är uppdelad i fyra regioner. Dessa är huvud, hals, kropp och plattform. 50S-underenheten har en central utbuktning med 5S rRNA och en stjälk med proteiner.
De flesta av proteinerna är basiska proteiner och har ett starkt samband med RNA, som är surt till sin natur. Ribosomalt RNA (rRNA) utgör mer än 80 % av det totala RNA som finns i bakteriecellen.
RÅDGÅNGAR:
Två underenheter av ribosomen associeras och dissocieras beroende på koncentrationen av magnesium. Ungefär 70 % av det ribosomala RNA:t är dubbelsträngat och spiralformat med olika stammar och slingor på grund av basparning mellan komplementära regioner. Interaktionen mellan 16S rRNA och mRNA hjälper 30S-underenheten att känna igen mRNA:s början. Ribosombindningsstället i prokaryoter ligger nära 5′-änden av mRNA uppströms startkoden AUG.
Mellan mRNA:s 5′-ända och AUG-kodonet finns många baser. Av dessa finns det en sekvens av 5′-AGGAGAGGU-3′. Denna kallas Shine-Dalgarno-sekvensen och ligger 4-7 baser uppströms från AUG. I 3′-änden av 16S rRNA finns en komplementär sekvens av 3′- AUUCCUCCA-5′. Denna sekvens binder mRNA till ribosomen.
En ribosom har två kanaler i den. Det linjära mRNA går in och ut genom den ena kanalen som har avkodningscentret. Denna kanal är tillgänglig för de laddade tRNA:erna. Den nysyntetiserade polypeptidkedjan undslipper genom den andra kanalen.
Ribosomens lilla underenhet innehåller avkodningscentrumet där laddade tRNA:er avkodar mRNA:s kodoner. Stora underenheten innehåller peptidyltransferascentrum, som bildar peptidbindningar mellan på varandra följande aminosyror. MRNA binder till 3′-änden av 16S RNA i ribosomens 30S-subenhet. 30S-underenheten, mRNA och laddat tRNA bildar tillsammans med initieringsfaktorer och GTP ett preinitieringskomplex. Senare förenas 50S-underenheten i ribosomen för att bilda 70S-initieringskomplexet.
Ribosomens viktigaste uppgift är att bilda peptidbindningar mellan på varandra följande aminosyror i den nysyntetiserade peptidkedjan.
Det finns två tRNA-bindningsställen på ribosomen. Den första platsen kallas ”P”-plats eller peptidylplats. Den andra platsen kallas ”A”-platsen eller aminoacylplatsen. Endast det initierande tRNA:t kommer in på ”P”-platsen. Alla andra tRNA:er går in på ”A”-platsen.
ADVERTISERINGAR:
Ribosomens viktigaste uppgift är att bilda peptidbindningar mellan på varandra följande aminosyror. Peptidbindningen bildas mellan aminosyran vid ”A”-platsen och peptidkedjan vid ”P”-platsen, vilket förlänger kedjan med en aminosyra. Man upptäckte att det peptidyltransferas som katalyserar bildandet av peptidbindningar mellan på varandra följande aminosyror består av flera proteiner och en 23S rRNA-molekyl. Detta 23S rRNA är ett ribozym och ansvarar för att katalysera bildandet av peptidbindningar mellan på varandra följande aminosyror.
Inom dessa två platser ”P” och ”A” finns en tredje plats ”E” eller exit site. Deacylerat tRNA (utan aminosyra) rör sig från ”P”-platsen till ”E”-platsen, varifrån det kastas ut.