Human rhinovirus.Wellcome Images. Rhinovirus är en viktig orsak till förkylning och kan bidra till ungefär hälften av astmautbrotten. Forskare har nu slutfört sekvenseringen av arvsmassan för alla kända typer av rhinovirus, vilket skapar förutsättningar för utveckling av läkemedel och vacciner för att bekämpa virusen.
Förkylningen är den vanligaste kända sjukdomen, som ger nysningar, kliande hals och rinnande näsa som vi alla är bekanta med. Människor i USA har uppskattningsvis 1 miljard förkylningar varje år.
Mer än 200 olika virus är kända för att orsaka symptomen på förkylning. Uppskattningsvis 30-35 % av alla förkylningar hos vuxna orsakas av rhinovirus. Hos personer med astma, särskilt barn, är rhinovirusinfektioner också ofta förknippade med uppblossningar. Forskare har tidigare identifierat 99 olika typer av rhinovirus. Nyligen upptäcktes dock ett antal okända typer hos patienter med allvarliga influensaliknande sjukdomar.
En forskargrupp ledd av dr Stephen B. Liggett vid University of Maryland School of Medicine resonerade att strategier för att bekämpa rhinovirus kommer att vara beroende av en bättre förståelse av rhinovirusens mångfald och evolution. Teamet började, med hjälp av interna medel, att komplettera de genetiska sekvenserna för alla kända typer av rhinovirus. Ann Palmenberg vid University of Wisconsin, Madison, som får stöd från NIH:s National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), samarbetade med analysen. Resultaten publicerades i tidskriften Science den 3 april 2009.
Forskarna sekvenserade de fullständiga genomerna av 70 kända humana rhinovirus och 10 andra från prover från näsvattnet från patienter med rhinovirusinfektioner i de övre luftvägarna. Den slutliga samlingen, inklusive de tidigare publicerade sekvenserna, bestod av 138 fullständiga genomer av mänskliga rhinovirus.
Forskarna jämförde alla sekvenser för att fastställa hur de är besläktade. Baserat på dessa släktskap upptäckte de att det kan finnas upp till fyra olika arter av rhinovirus.
Rhinovirus innehåller all sin genetiska information på en enda sträng av RNA (en molekyl som är besläktad med DNA). Forskarna fann att alla virusens RNA-strängar har en klöverbladsliknande form i ena änden. Nästan alla virus hade en unik sekvens i en del av denna region. Analoga regioner i besläktade virus har visat sig påverka hur sjukdomsframkallande virusen är. Forskarna tror att denna sekvenssträcka kan spela en liknande roll i rhinovirus.
Forskarna fann också bevis för att avlägset besläktade stammar bytte ut delar av RNA. Exakt var och hur virusen utbyter genetiskt material i kroppen är osäkert, men flera rhinovirus är kända för att infektera människor samtidigt.
Dessa studieresultat ger en ram för att analysera mänskliga rhinovirus som kan slå till i framtiden. Informationen kan användas i studier för att följa rörelsen och utvecklingen av nya virus. Den kan också visa sig värdefull för att utveckla antivirala läkemedel och vacciner.
av Harrison Wein, Ph.D.