Strukturer av aktin och aktinkomplex. Strukturerna av aktinkomplex visas i skala och i kronologisk ordning efter publicering. (a) Klassisk vy av aktinmonomerens struktur. Den visade strukturen härstammar från komplexet med DNas I, med komplettering av C-terminen från komplexet av aktin med profilin. I orange markerade är Ser14- och metylerade His73-slingorna, den DNase I-bindande slingan och gångjärnet mellan domänerna, som består av helixen Gln137-Ser145 och slingan som är centrerad vid rest Lys336. Subdomänerna 1–4 är märkta. (De är också märkta i panelerna f och m, som visar roterade vyer av strukturen). Tillsammans bildar subdomänerna 1 och 2 den yttre (eller lilla) domänen, medan subdomänerna 3 och 4 utgör den inre (eller stora) domänen. Två stora klyftor bildas mellan dessa domäner: nukleotid- och målbindningsklyftan. De flesta aktinbindande proteiner (ABP) och små molekyler binder i den målbindande klyftan, och interaktionen involverar ofta en α-helix (magenta). (b) DNas I (1ATN). (c) Gelsolin segment 1 (G1) (1EQY). Se även kompletterande figur 1 för strukturer av aktin med Gelsolin-fragmenten G1–G3 och G4–G6. (d) β-actin-profilin (2BTF). (e) Vitamin D-bindande protein ( DBP ) (1KXP). (f) Två vinkelräta vyer av en överlagring av strukturer av aktinkomplex med små molekyler, inklusive marina toxiner (1QZ5, 1QZ5, 1S22, 1YXQ, 2ASM, 2ASO, 2ASP, 2FXU, 2Q0R, 2Q0U, 2VYP), Latrunculin B (2Q0U) och cytokalasin D (3EKS). De marina toxinerna (magenta) binder i ändarna av den målbindande klyftan, medan cytokalasin D binder i mitten och latrunculin (både A och B) binder i nukleotidklyftan. Alla dessa molekyler äventyrar aktinpolymeriseringen. (g) β-thymosin-domän. En fullständig struktur av detta komplex finns inte tillgänglig, men tillsammans ger strukturerna av den N-terminala delen av en β-thymosindomän från Drosophila ciboulot (1SQK) och den C-terminala änden av b-thymosinpeptiden (Tβ4) (1T44) en modell av detta komplex. (h) WASP homology domain 2 (WH2)-domän från WASP (2A3Z). WH2-domänen, som finns i många cytoskeletala proteiner i form av tandemrepetitioner, är besläktad med β-thymosin-domänen men saknar den C-terminala spetsiga ändar som täcker helixen. (i) Formin homology 2 (FH2)-domän (1Y64). Se även kompletterande figur 2 för en mer detaljerad representation av denna struktur. (j) Ternärt komplex med profilin och de Pro-rich G-actin-bindande (Pro-rich-GAB) domänerna av VASP (2PBD). GAB-domänen är besläktad med WH2-domänen men har en kortare N-terminal helix och antar en något annorlunda orientering när den är bunden till aktin, möjligen för att den är utformad för att sambindas med profilin. (k) Toxofilin från Toxoplasma gondii bundet till en antiparallellisk aktindimer (2Q97). (l) RPEL-domän (RPxxxEL-containing motif) från serumresponsfaktorns koaktivator MAL (2V52). (m) Arginin ADP-ribosylering iota-toxin från Clostridium perfringens (3BUZ). Vyn är roterad 90° i förhållande till de andra komplexen. (n) C-terminal ADF/cofilin-domän från twinfilin (3DAW). Se kompletterande tabell 1 för en fullständig förteckning över referenser.