Honduras Közép-Amerika második legnagyobb országa. Északon Guatemala, nyugaton El Salvador, délen pedig Nicaragua határolja. Határait vizek határozzák meg. Honduras partjainak összegében a Karib-tenger húzódik, Hondurast pedig a Rio Montagua és a Rio Coco folyók szegélyezik. Ezeken a vizeken számos kisebb és nagyobb sziget is Honduras területére esik.
A szárazföldi Honduras meghatározó jellegzetességei a gyönyörű hegyek. Az ország szárazföldi területének több mint 80%-át teszik ki. A nyugati hegyek lélegzetelállítóak, a legmagasabb csúcsok közel 9000 lábig érnek. Honduras hegyvonulatait egy észak-déli irányban húzódó hosszú mélyedés választja ketté, amely az ország belsejében az egyetlen alföldet alkotja.
Honduras északi partvidékét folyóvölgyek és alacsony parti síkságok alkotják. A guatemalai határhoz közeli partvidék erősen kiépített; a keleti partok határozottan barátságosabbak a kishajós hondurasi körutazáson egy kis magányra vágyó utazók számára. Hondurasnak van egy nagyon rövid partja a Csendes-óceán mentén, amely kissé mocsaras és mangrovefákkal tarkított.