Human rhinovirus.Wellcome Images. Rinovirukset ovat merkittävä flunssan aiheuttaja, ja ne voivat olla osasyynä noin puoleen astman puhkeamisesta. Tutkijat ovat nyt saaneet valmiiksi kaikkien tunnettujen rinovirustyyppien genomien sekvensoinnin, mikä luo edellytykset lääkkeiden ja rokotteiden kehittämiselle viruksia vastaan.
Nuhakuume on tunnetuin sairaus, joka aiheuttaa meille kaikille tuttua aivastelua, kurkun raapimista ja nuhaa. Yhdysvalloissa ihmiset sairastavat vuosittain arviolta miljardi flunssaa.
Yleisen flunssan oireita tiedetään aiheuttavan yli 200 eri virusta. Arviolta 30-35 % kaikista aikuisten vilustumisista aiheutuu rinoviruksista. Astmaa sairastavilla ihmisillä, erityisesti lapsilla, rinovirusinfektioihin liittyy usein myös puhkeamisia. Tutkijat olivat aiemmin tunnistaneet 99 erilaista rinovirustyyppiä. Äskettäin kuitenkin havaittiin useita tuntemattomia tyyppejä potilailla, joilla oli vakavia flunssan kaltaisia sairauksia.
Tohtori Stephen B. Liggettin johtama tutkimusryhmä Marylandin yliopiston lääketieteellisestä tiedekunnasta päätteli, että strategiat rinovirusten torjumiseksi riippuvat rinovirusten monimuotoisuuden ja evoluution paremmasta ymmärtämisestä. Ryhmä ryhtyi sisäisin varoin selvittämään kaikkien tunnettujen rinovirustyyppien geneettisiä sekvenssejä. Tohtori Ann Palmenberg Madisonin Wisconsinin yliopistosta, jota tukee NIH:n National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), osallistui analyysiin. Tulokset ilmestyivät Science-lehdessä 3. huhtikuuta 2009.
Tutkijat sekvensoivat 70 tunnetun ihmisen rinoviruksen ja 10 muun ihmisen rinoviruksen täydelliset genomit, jotka saatiin rinoviruksen aiheuttamia ylähengitystieinfektioita sairastavien potilaiden nenänhuuhtelunäytteistä. Lopullinen kokoelma, mukaan lukien aiemmin julkaistut sekvenssit, koostui 138 ihmisen rinoviruksen täyspitkästä genomista.
Tutkijat vertasivat kaikkia sekvenssejä selvittääkseen, miten ne liittyvät toisiinsa. Näiden sukulaisuussuhteiden perusteella he havaitsivat, että rinoviruksia voi olla jopa neljä eri lajia.
Rinovirukset sisältävät kaiken geneettisen informaationsa yhdellä RNA-juosteella (DNA:han liittyvä molekyyli). Tutkijat havaitsivat, että kaikissa virusten RNA-juosteissa on toisessa päässä apilanlehden kaltainen muoto. Lähes jokaisella viruksella oli ainutlaatuinen sekvenssi tämän alueen osassa. Samankaltaisten alueiden sukulaisviruksissa on osoitettu vaikuttavan siihen, kuinka patogeenisiä virukset ovat. Tutkijat uskovat, että tällä sekvenssiosuudella saattaa olla samanlainen rooli rinoviruksissa.
Tutkijat löysivät myös todisteita siitä, että kaukana toisistaan olevat kannat vaihtavat RNA:n osia. Se, missä ja miten virukset tarkalleen vaihtavat geneettistä materiaalia elimistössä, on epävarmaa, mutta useiden rinovirusten tiedetään tartuttavan ihmisiä samanaikaisesti.
Tämän tutkimuksen tulokset tarjoavat puitteet tulevaisuudessa mahdollisesti iskevien ihmisen rinovirusten analysoimiseksi. Tietoja voidaan käyttää tutkimuksissa, joilla seurataan uusien virusten liikkumista ja kehittymistä. Se voi myös osoittautua arvokkaaksi viruslääkkeiden ja rokotteiden kehittämisessä.
– Harrison Wein, Ph.D.