Eroja fyysisissä ominaisuuksissa
Hyönteisillä ja sammakkoeläimillä on suuria fyysisiä eroja. Matelijoilla on kuiva ja hilseilevä iho, kun taas sammakkoeläinten iho tuntuu kostealta ja joskus melko tahmealta. Ne ovat selkärankaisia ja kylmäverisiä kuten sammakkoeläimet. Matelijoihin verrattuna sammakkoeläimillä on sileä iho. Useimpien sammakkoeläinten iho ei ole vedenkestävä toisin kuin matelijoilla. Vaikka useimmilla sammakkoeläimillä on keuhkot, ne hengittävät yleensä ihon ja suun limakalvon kautta, kun taas useimmat matelijat eivät. Useimmilla sammakkoeläimillä on neljä raajaa. Raajat ja keuhkot ovat maalla elämisen sopeutumia ja erottavat ne matelijoista.
Lisääntyminen
Kumpikin matelijoista ja sammakkoeläimistä lisääntyy munimalla, mutta matelijoilla on kovia nahkamaisia munia, jotka suojaavat niiden sisällä olevia poikasia, ja ne munitaan usein hautautuneisiin, eristettyihin pesiin. Sammakkoeläinten munat ovat pehmeitä ilman minkäänlaista ulkopuolista kalvoa, ja ne kiinnittyvät yleensä vesikasvien varsiin.
Elinympäristö vedessä
Sammakkoeläimet ovat tyypillisesti vesieläimiä, matelijat taas eivät.
Tyypit
Sammakkoeläimiä on kolme pääluokkaa (järjestystä): sammakkoeläimet (urodeles), sammakot ja sammakot (anurans) sekä kausiliskot (matomaiset gymnophionit). Yleinen harhaluulo on, että etanat ovat sammakkoeläimiä – vaikka osa etanoista esiintyy maalla ja osa vedessä, nämä ovat kaksi erillistä lajia; etanat eivät ole sammakkoeläimiä.
Tänä päivänä on olemassa neljä matelijoiden järjestystä. Crocodilia viittaa eläimiin, kuten krokotiileihin ja alligaattoreihin. Squamata viittaa liskoihin, käärmeisiin ja vastaaviin eläimiin. Kaikki kilpikonnat kuuluvat Testudines-järjestykseen. Rhynchocephalia-luokkaan kuuluu vain kaksi lajia, jotka tunnetaan nimellä tuatarat ja jotka ovat kotoisin Uudesta-Seelannista.
Elämänpuu, joka osoittaa kaikkien elävien organismien luokittelun. Sammakkoeläimet ja matelijat ovat molemmat selkärankaisia.
Matelijoiden ja sammakkoeläinten evoluutio
Matelijoiden evoluutio
Hylonomus on vanhin tunnettu matelija oli noin 8-12 tuuman pituinen ja peräisin 200 miljoonaa vuotta sitten. Ensimmäiset todelliset ”matelijat” (Sauropsidit) luokitellaan Anapsideihin, joilla oli kiinteä kallo, jossa oli reikiä vain nenää, silmiä, selkäydintä jne. varten. Jotkut pitävät kilpikonnia elossa olevina anapsideina. Pian ensimmäisten matelijoiden jälkeen haarautui kaksi haaraa, joista toinen johti anapsideihin, joiden kalloon ei kehittynyt reikiä. Toisella ryhmällä, Diapsidoilla, oli kallossaan pari reikää silmien takana, ja toinen pari sijaitsi korkeammalla kallossa. Diapsidat jakaantuivat jälleen kahteen sukulinjaan, lepidosauruksiin (joihin kuuluvat nykyiset käärmeet, liskot ja tuatarat sekä kiistanalaisesti myös mesotsooisen kauden sukupuuttoon kuolleet merihyönteiset) ja arkkosauruksiin (joita edustavat nykyään vain krokotiilit ja linnut, mutta joihin kuuluvat myös lentoliskot ja dinosaurukset).
Varhaisimmat kiinteäkalloiset amniootit synnyttivät myös erillisen sukulinjan, synapsidat. Synapsidit kehittivät kalloonsa silmien taakse pari reikää (diapsidien tapaan), joita käytettiin sekä keventämään kalloa että lisäämään tilaa leukalihaksille. Synapsidit kehittyivät lopulta nisäkkäiksi.
Käpyeläinten evoluutio
Ensimmäiset suuret sammakkoeläinryhmät kehittyivät devonikaudella( Geologinen ajanjakso noin 350 miljoonaa vuotta sitten) nykyajan kelikanttien kaltaisista kaloista, joiden evät olivat kehittyneet jaloiksi. Nämä sammakkoeläimet olivat noin viisi metriä pitkiä, mikä on nykyään harvinaista. Hiilikaudella sammakkoeläimet siirtyivät ravintoketjussa ylöspäin ja alkoivat vallata ekologista asemaa, jossa nyt on krokotiileja. Nämä sammakkoeläimet söivät huomattavan paljon megahyönteisiä maalla ja monenlaisia kaloja vedessä. Permin ja triaskauden loppupuolella sammakkoeläimet alkoivat kilpailla alkukrokotiilien kanssa, mikä johti niiden koon pienenemiseen lauhkeilla vyöhykkeillä tai niiden siirtymiseen napa-alueille. (Sammakkoeläimet pystyivät talvehtimaan talviunille, kun taas krokotiilit eivät pystyneet, jolloin korkeammilla leveysasteilla elävät sammakkoeläimet saivat suojaa matelijoilta.)
Herpetologia
Zoologian haaraa, joka käsittelee sammakkoeläinten ja matelijoiden tutkimusta, kutsutaan herpetologiaksi. Pelkästään sammakkoeläinten tutkimusta kutsutaan batrakologiaksi. Esimerkkejä sammakkoeläimistä ovat sammakot, konnat, salamanterit, muurahaiset ja kausiliskot. Matelijoita ovat esimerkiksi kilpikonnat ja kilpikonnat, liskot, käärmeet, krokotiilit ja alligaattorit, terrapiinit ja tuatarat.