Perinnöllinen munasarjasyöpä on munasarjasyövän voimakkain riskitekijä. Perinnöllisen munasarjasyövän kolme kliinistä ilmenemismuotoa on tunnistettu: (1) ”paikkasidonnainen” munasarjasyöpä, (2) rinta- ja munasarjasyöpäoireyhtymä ja (3) perinnöllinen nonpolyposis-kolorektaalisyöpä (HNPCC; Lynch II) -oireyhtymä. Kaksi ensimmäistä ryhmää liittyvät BRCA1- ja BRCA2-kasvainsuppressorigeenien mutaatioihin, kun taas HNPCC liittyy DNA-virheenkorjausgeenien (DNA mismatch repair, MMR) mutaatioihin, pääasiassa hMLH1:n ja hMSH2:n mutaatioihin. Vähintään 10 prosenttia kaikista epiteliaalisista munasarjasyövistä on perinnöllisiä, ja BRCA-geenien mutaatiot aiheuttavat noin 90 prosenttia tapauksista ja suurin osa jäljelle jäävästä 10 prosentista johtuu HNPCC:stä. Perinnöllisillä munasarjasyövillä on erilaisia kliinis-patologisia piirteitä kuin sporadisilla syövillä. Munasarjasyövän kumulatiivinen elinikäinen riski on 40-50 prosenttia BRCA1-mutaation kantajilla ja 20-30 prosenttia BRCA2-mutaation kantajilla. Molemmat BRCA-proteiinit osallistuvat geeniekspression transkriptionaaliseen säätelyyn sekä tiettyjen DNA-vaurioiden, erityisesti kaksoissidekatkosten, tunnistamiseen tai korjaamiseen. BRCA1:n ja BRCA2:n mutaatiot ovat pääasiassa frameshift- tai nonsense-mutaatioita. Suurin osa munasarjasyövistä, joihin liittyy sukusolulinjan BRCA-mutaatioita, diagnosoidaan nuorempana, ja ne ovat korkea-asteisia ja pitkälle edenneitä seroottisia karsinoomia. BRCA-mutaatioilla ei näytä olevan merkittävää merkitystä munasarjojen limakalvo- tai rajakasvainten kehittymisessä. Perinnöllisillä munasarjasyöpätapauksilla on selvästi parempi kliininen lopputulos: kokonaiselossaoloaika on pidempi ja sytostaattihoidon jälkeinen uusiutumisvapaa aika pidempi kuin sporadisilla syövillä. Naisten, joiden suvussa on kaksi tai useampia ensimmäisen tai toisen asteen sukulaisia, joilla on joko pelkkä munasarjasyöpä tai sekä rinta- että munasarjasyöpä, olisi tehtävä ennaltaehkäisevä munasarjojen poistoleikkaus heti synnytyksen päätyttyä munasarjasyövän riskin pienentämiseksi. Munasarjasyövän kumulatiivinen riski HNPCC-suvuissa on yli 12 %. HNPCC-oireyhtymässä munasarjasyöpä diagnosoidaan nuorempana kuin väestössä yleensä. Useimmat kasvaimet ovat matalassa vaiheessa olevia hyvin erilaistuneita tai kohtalaisesti erilaistuneita karsinoomia. Näille potilaille suositellaan vuosittaista seurantaa.