Jan van Helmont oli historian aiheiden, genrekohtausten ja muotokuvien maalari. Hän maalasi monia muotokuvia aikansa merkittävistä henkilöistä, kuten Johannes Jacobus Moretus ja hänen vaimonsa Theresia Mechtildis Schilders (1717, Plantin-Moretus-museo), Antwerpenissä sijaitsevan Plantin-Moretus-painon silloiset omistajat. Hän sai Antwerpenin kaupungin viranomaisilta säännöllisesti toimeksiantoja maalata muotokuvia historiallisista henkilöistä, kuten Parman herttuan Alexander Farnesen, ja restauroida 34 hallitsijan muotokuvat Antwerpenin kaupungintalon valtiosalissa.
Joitakin van Helmontin muotokuvamaalauksia kaiversi myöhemmin hollantilainen kaivertaja Jacob Houbraken. Yksi esimerkki on Adriaan van Borssele van der Hoogen muotokuva, jonka Houbraken kaiversi Aart Schoumanin Jan van Helmontin maalauksen pohjalta tekemän piirroksen pohjalta. Jan van Helmont teki piirustuksia Antwerpenin kaivertajan Gaspar Bouttatsin kaiverruksia varten. Esimerkkinä voidaan mainita vaakuna ovaalissa, jota reunustavat enkelit (n. 1674 British Museum), joka on Bouttatsin kaiverrus van Helmontin piirustuksen pohjalta aatelisneito Isabelle de Berchemin muistolaatasta.
Jan van Helmont loi uskonnollisiin aiheisiin liittyviä historiamaalauksia eri puolilla Flanderia sijaitseviin kirkkoihin, muun muassa Aalstissa, Willebroekissa ja Wambeekissa.
Wienissä sijaitsevan Sotahistoriallisen museon kokoelmissa on Jan van Helmontin tekemä ”vartiokohtaus”. Vartiohuonekohtaus kuvaa tyypillisesti kohtausta, jossa upseerit ja sotilaat osallistuvat ilonpitoon. Vartiohuonekohtauksiin sisältyi usein palkkasotureita ja prostituoituja jakamassa saalista, ahdistelemassa vankeja tai harrastamassa muunlaista tuomittavaa toimintaa. Tyylilaji tuli suosituksi 1600-luvun puolivälissä, erityisesti Alankomaiden tasavallassa. Myös Flanderissa oli muutamia lajityypin harjoittajia, kuten David Teniers nuorempi, Abraham Teniers, Anton Goubau, Cornelis Mahu, Jan Baptist Tijssens nuorempi ja Jan van Helmontin isä Mattheus. Van Helmontin sommitelma kuvaa sotilaita portin edessä. Vasemmalla on sotilas, joka pitää lippua ylhäällä tykin, asekasan, haarniskan ja rummun yllä. Kuvassa esitetyt haarniskat olivat maalaushetkellä jo vanhentuneita, sillä metalliset haarniskat, rintapanssarit ja kypärät poistuivat käytöstä 1620-luvulta alkaen. On mahdollista, että tyylilajin moralisoivan tarkoituksen mukaisesti haarniska on viittaus vanitas-motiiviin vallan ja maineen katoavaisuudesta.