15. tammikuuta 2020
CDC, useiden osavaltioiden kansanterveys- ja sääntelyviranomaiset ja U.S. Food and Drug Administrationulkopuolinen kuvake (FDA) tutkivat usean osavaltion laajuista Shiga-toksiinia tuottavan E. coli (STEC) O157:H7 -infektioiden taudinpurkausta.
Väestöterveydenhuollon tutkijat käyttivät PulseNet-järjestelmää tunnistaakseen sairaudet, jotka voivat olla osa tätä taudinpurkausta. PulseNet on CDC:n koordinoima kansanterveys- ja elintarvikevirastojen laboratorioiden kansallinen alatyypinmääritysverkosto. Sairastuneista eristetyille E. coli -bakteereille tehdään DNA-sormenjälki käyttämällä standardoitua laboratorio- ja data-analyysimenetelmää, jota kutsutaan koko genomin sekvensoinniksi (WGS). CDC PulseNet hallinnoi kansallista tietokantaa näistä sekvensseistä, joita käytetään mahdollisten taudinpurkausten tunnistamiseen. WGS antaa tutkijoille yksityiskohtaista tietoa sairautta aiheuttavista bakteereista. Tässä tutkimuksessa WGS osoitti, että sairastuneista eristetyt bakteerit olivat geneettisesti läheistä sukua. Tämä tarkoittaa, että taudinpurkaukseen osallistuneilla ihmisillä oli todennäköisesti yhteinen tartuntalähde. WGS osoitti myös, että tämän taudinpurkauksen aiheutti sama E. coli O157:H7 -kanta, joka aiheutti lehtivihanneksiin liittyviä taudinpurkauksia vuonna 2017 ja romaine-salaattiin liittyviä taudinpurkauksia vuonna 2018.
Kokonaisuudessaan 27 osavaltiosta raportoitiin 167 ihmistä, jotka saivat tartunnan taudinpurkauksen aiheuttaneeseen E. coli O157:H7 -kantaan. Luettelo osavaltioista ja kunkin osavaltion tapausten lukumäärästä löytyy Kartta ilmoitetuista tapauksista -sivulta. Kanadan kansanterveysvirastoulkopuolinen kuvake ilmoitti myös useista sairastumisista, jotka liittyivät geneettisesti läheisesti Yhdysvalloissa esiintyneisiin sairastumisiin.
Sairastumiset alkoivat päivämäärinä, jotka vaihtelivat 20. syyskuuta 2019 ja 21. joulukuuta 2019 välillä. Sairastuneiden ikä vaihteli alle 1 vuodesta 89 vuoteen, ja mediaani-ikä oli 27 vuotta. Sairastuneista 64 prosenttia oli naisia. Niistä 165 sairastuneesta, joiden tiedot olivat saatavilla, ilmoitettiin 85 (52 %) sairaalahoitoa, mukaan lukien 15 henkilöä, joille kehittyi hemolyyttis-ureeminen oireyhtymä (HUS), eräänlainen munuaisten vajaatoiminta. Kuolemantapauksia ei raportoitu.
WGS-analyysi 159:stä sairastuneesta henkilöstä saaduista bakteeri-isolaateista ei ennustanut antibioottiresistenssiä 157:llä isolaatista, mutta ennusti resistenssiä kahdella isolaatilla. Yksi isolaatti sisälsi resistenssigeenin ampisilliinille, ja toinen isolaatti sisälsi resistenssigeenit ampisilliinille, kloramfenikolille, streptomysiinille, sulfisoksatsolille ja tetrasykliinille. Viiden salaattinäytteestä saadun bakteeri-isolaatin WGS-analyysi ei ennustanut mikrobilääkeresistenssiä. CDC:n kansallisen mikrobilääkeresistenssin seurantajärjestelmän (National Antimicrobial Resistance Monitoring System, NARMS) laboratorio tekee parhaillaan kliinisten isolaattien tavanomaisia antibioottiresistenssitestejä. Nämä havainnot eivät vaikuta hoito-ohjeisiin, sillä antibiootteja ei suositella potilaille, joilla on E. coli O157 -infektio.
Epidemian tutkinta
Epidemiologiset, laboratorio- ja jäljitettävyysnäytteet osoittivat, että Kaliforniassa sijaitsevalta Salinas Valleyn viljelyalueelta peräisin oleva romaine-salaatti oli todennäköinen lähde tälle epidemiologiselle taudinpurkaukselle.
Haastatteluissa sairastuneet vastasivat kysymyksiin elintarvikkeista, joita he söivät, ja muusta altistumisesta sairastumistaan edeltävällä viikolla. Yhdeksänkymmentäneljä (83 %) 113 haastatellusta ilmoitti syöneensä romaine-salaattia. Tämä prosenttiosuus oli huomattavasti korkeampi kuin terveille ihmisille tehdyn tutkimuksen pdf-kuvakkeen tulokset, joissa 47 % ilmoitti syöneensä romainesalaattia haastattelua edeltävällä viikolla. Sairastuneet ilmoittivat syöneensä erityyppisiä romainesalaatteja useissa ravintoloissa ja kotona.
Marylandin terveysministeriö (Maryland Department of Healthexternal icon) tunnisti E. coli O157:H7 -kolibakteerikannan avaamattomasta Ready Pac Foods Bistro® Chicken Caesar Salad -paketista, joka oli kerätty sairastuneen henkilön kotoa Marylandista. Wisconsin Department of Health Servicesexternal icon identified the outbreak straam of E. coli O157:H7 in a unopened bag of Fresh Express® Leafy Green Romaine collected from an sick person’s home in Wisconsin. Salinas Valleyn viljelyalue Kaliforniassa oli molemmissa tuotteissa käytetyn romainesalaatin pääasiallinen lähde.
FDA ja osavaltiot jäljittivät joidenkin sairastuneiden syömien romainesalaattien lähteen. Kerätyt tiedot osoittivat, että kyseinen romainesalaatti oli korjattu Kaliforniassa sijaitsevalta Salinas Valleyn viljelyalueelta. Lisätietoja jäljitystutkimuksesta on FDA:n verkkosivuillaulkosymboli.
Kalifornian Salinas Valleyn viljelyalueelta peräisin olevaa saastunutta romainesalaattia ei ole enää myynnissä. Tammikuun 15. päivästä 2020 alkaen tämä taudinpurkaus näyttää olevan ohi.