Im letzten Jahrzehnt haben genomische Ansätze begonnen, das Studium der Tiervielfalt zu revolutionieren. Insbesondere die Genomsequenzierungsprogramme haben sich über die traditionellen Modellarten hinaus ausgeweitet und umfassen eine zunehmende Vielfalt von Tieren aus vielen verschiedenen Phyla sowie einzellige Eukaryoten, die eng mit den Tieren verwandt sind. Vollständige Genomsequenzen ermöglichen es den Forschern, mit hinreichender Sicherheit das vollständige Komplement einer bestimmten Genfamilie in einem Genom zu bestimmen. Der Vergleich von Genkomplementen aus entsprechenden Genomen kann die Evolutionsgeschichte von Genfamilien aufzeigen und Aufschluss darüber geben, wann sowohl eine Gendiversifizierung als auch ein Genverlust stattgefunden hat. Darüber hinaus ermöglichen assemblierte Genome aber auch die Analyse des genomischen Umfelds, in dem sich einzelne Gene befinden, und den Vergleich zwischen verschiedenen Arten. Dies kann Aufschluss darüber geben, wie es zur Gendiversifizierung kam. Hier konzentrieren wir uns auf die Fox-Gene und ziehen mehrere Tiergenome heran, um einen evolutionären Rahmen zu entwickeln, der den Zeitpunkt und den Mechanismus der Entstehung der Vielfalt der Fox-Gene bei Tieren erklärt. Alte Verknüpfungen zwischen Genen sind ein herausragendes Merkmal der Fox-Gene und zeigen eine Geschichte von Genclustern, von denen einige für das Verständnis der Funktion von Fox-Genen relevant sein könnten.