AnderlechtEdit
În ciuda interesului celor de la Arsenal din Premier League, Jordan a semnat primul său contract profesionist cu clubul, care l-a păstrat până în 2013.
După ce s-a antrenat anterior cu prima echipă în sezonul 2010-11, alături de fratele său (care a părăsit apoi clubul pentru Chelsea la acea vreme), Lukaku a fost inclus pentru prima dată într-o echipă de seniori la 1 decembrie 2011, rămânând rezervă neutilizată în victoria cu 2-1 a lui Anderlecht pe terenul lui AEK Atena, în faza grupelor din sezonul respectiv al UEFA Europa League. Debutul său a avut loc la 21 martie 2012, la 21 martie 2012, în meciul cu Zulte Waregem, în care Anderlecht a câștigat cu 2-1; Lukaku a declarat ulterior, după meci: „a fost cea mai bună zi din viața lui”. Apoi, pe 6 aprilie, când a fost titular într-un meci de Pro League fără goluri pe terenul lui Standard Liège; el a totalizat șase apariții în timp ce echipa sa a câștigat campionatul în acel sezon.
Cu toate acestea, el nu a jucat deloc când au păstrat titlul în campania următoare, ajungând pe bancă doar de două ori. În timpul sezonului, a ratat startul sezonului, din cauza unei fracturi de stres. Pe măsură ce se zbătea în prima echipă, Jordan a fost legat de o mutare sub formă de împrumut la un club necunoscut din Eredivisie, dar a respins mutarea și a fost trimis în schimb la echipa de rezervă.
La 21 iulie 2013, a intrat în minutul 87 în locul lui Matías Suárez, când Anderlecht a câștigat Supercupa Belgiei din acel an cu 1-0 împotriva lui Genk pe stadionul Constant Vanden Stock. Cu toate acestea, după ce a apărut în două meciuri la începutul sezonului, Jordan și-a anunțat dorința de a părăsi clubul pentru a obține un fotbal regulat la prima echipă.
OostendeEdit
La scurt timp după ce a jucat în Supercupa Belgiei, Lukaku a părăsit Anderlecht pentru a se alătura echipei Oostende sub formă de împrumut până la sfârșitul sezonului.
Lukaku și-a făcut debutul la Oostende, unde a intrat ca rezervă în a doua repriză și a jucat 45 de minute, într-o înfrângere cu 1-0 împotriva lui Lokeren la 31 august 2013. De la debutul său la Oostende, Lukaku s-a impus ca titular în prima echipă, chiar și ca rezervă, iar într-un meci cu Genk, pe 23 noiembrie 2013, a fost autorul unuia dintre goluri, în victoria cu 4-0. Cu toate acestea, ultima apariție a lui Lukaku pentru club a avut loc la 25 ianuarie 2014, împotriva lui Waasland-Beveren. Lukaku nu a mai apărut niciodată pentru club, deoarece a suferit o pubalgie care l-a ținut în afara sezonului. În ciuda acestui fapt, Lukaku a continuat să facă cincisprezece apariții în toate competițiile.
Cu contractul său expirând la Anderlecht la sfârșitul sezonului, Lukaku s-a alăturat permanent echipei Oostende, semnând un contract pe patru ani. Primul meci al lui Lukaku după ce a semnat definitiv cu clubul a avut loc la 1 august 2014, jucând împotriva fostului său club, Anderlecht, într-o înfrângere cu 2-0. Lukaku a continuat să fie titular în prima echipă la Oostende, în ciuda faptului că a fost absent în două rânduri, inclusiv în meciul cu Gent din 25 ianuarie 2015, când a fost eliminat. În primul său sezon permanent la club, Lukaku a ajuns să facă treizeci de apariții în toate competițiile.
În sezonul 2015-16, Lukaku a început bine sezonul, când a stabilit unul dintre goluri, în victoria cu 3-1 împotriva lui Mechelen în meciul de deschidere a sezonului, urmat de marcarea primului său gol pentru club, în victoria cu 2-1 împotriva lui Westerlo, în care a fost numit echipa săptămânii. Lukaku a continuat să fie în prima echipă până la absența de la sfârșitul anului 2015, din cauza accidentărilor. Lukaku a marcat apoi al doilea său gol al sezonului pe 31 ianuarie 2016, într-o remiză de 3-3 cu Mouscron. După ce a revenit după accidentare la începutul lunii mai, Lukaku a marcat din cauza accidentării sale, într-o victorie cu 2-1 cu Genk, la 14 mai 2016. Lukaku a încheiat cel de-al doilea sezon al său, făcând treizeci și patru de apariții și marcând de trei ori în toate competițiile.
LazioEdit
Cu o aluzie din partea președintelui clubului, în care se spunea că Lukaku ar putea părăsi clubul în vară, s-a anunțat la 22 iulie 2016, că a semnat cu clubul italian Lazio pentru 4 milioane de euro, plus un milion de euro, conform rapoartelor, în bonusuri legate de performanță. La sosirea la club, Lukaku a primit tricoul cu numărul șase și a fost prezentat clubului câteva zile mai târziu.
Lukaku a debutat la Lazio, unde a fost titular și a jucat tot meciul, într-o victorie cu 4-3 în fața Atalantei, în meciul de deschidere al sezonului. El a continuat să rămână în prima echipă până când a suferit o accidentare în timpul unei pauze internaționale care l-a ținut în afara lotului timp de o lună. Abia pe 27 noiembrie 2016 a revenit după accidentare, intrând pe teren ca rezervă în a doua repriză, într-o victorie cu 1-0 în fața lui Palermo.
În Supercoppa Italiana 2017, Lukaku a intrat pe teren ca rezervă de ultimă oră în victoria cu 3-2 în fața lui Juventus, pe Stadio Olimpico. La 23 decembrie același an, el a marcat primul său gol pentru club, finalizând din pasa lui Ciro Immobile pentru a deschide o victorie cu 4-0 pe teren propriu în fața lui Crotone.
Problemele de accidentare din timpul sezonului 2018-19 au făcut ca Lukaku să fie titular doar în trei meciuri în toate competițiile, înainte de a se ajunge la un acord de împrumut până la finalul sezonului cu clubul englez Newcastle United, la 24 ianuarie. Cu toate acestea, acordul a fost anulat a doua zi după ce belgianul ar fi picat la vizita medicală.
Antwerp (împrumut)Edit
La 5 octombrie 2020, Lazio a confirmat că Lukaku s-a alăturat clubului belgian Royal Antwerp F.C. pentru un împrumut pe un an.
.