Orașul New York este situat pe coasta de nord-est a Statelor Unite, la gura de vărsare a râului Hudson, în sud-estul statului New York. Este situat în estuarul portuar New York-New Jersey, a cărui piesă centrală este portul New York, ale cărui ape adânci și golfuri adăpostite au contribuit la creșterea importanței orașului în calitate de oraș comercial. O mare parte din New York este construită pe cele trei insule Manhattan, Staten Island și vestul Long Island, ceea ce face ca terenurile să fie rare și încurajează o densitate mare a populației.
Râul Hudson curge din Valea Hudson în Golful New York, devenind un estuar cu maree care separă Bronxul și Manhattanul de nordul New Jersey. Râul Harlem, o altă strâmtoare cu maree între râurile East și Hudson, separă Manhattanul de Bronx.
Birourile orașului New York se află la granița dintre două provincii geologice din estul Americii de Nord. Brooklyn și Queens, situate pe Long Island, fac parte din câmpia de coastă estică. Long Island este o morena masivă care s-a format la marginea sudică a calotei glaciare Laurentide în timpul ultimei ere glaciare. Bronx și Manhattan se află la marginea estică a bazinului Newark, un bloc de scoarță terestră care s-a scufundat în jos în timpul dezintegrării supercontinentului Pangeea în timpul perioadei triasice. Pragul Palisades Sill de pe malul din New Jersey al râului Hudson expune roci antice, odinioară topite, care au umplut bazinul. Roci metamorfice rezistente stau la baza unei mari părți din Manhattan, oferind un suport solid pentru numeroșii săi zgârie-nori.
Teritoriul orașului a fost modificat în mod considerabil de intervenția umană, cu o asanare substanțială a terenurilor de-a lungul fronturilor de apă încă din perioada colonială olandeză. Recuperarea este cea mai notabilă în Lower Manhattan, cu dezvoltări moderne precum Battery Park City. O mare parte din variațiile naturale ale topografiei au fost uniformizate, în special în Manhattan. Partea de vest a Manhattanului păstrează unele coline, în special în Upper Manhattan, în timp ce partea de est a fost considerabil aplatizată. Duffy’s Hill din East Harlem este o excepție notabilă de la denivelarea relativ plană a East Side.
Suprafața orașului este estimată la 321 de mile pătrate (830 km2). Cu toate acestea, o estimare mai recentă calculează o suprafață totală a terenului de 304,8 mile pătrate (789,4 kilometri pătrați). Cel mai înalt punct natural din oraș este Todt Hill din Staten Island, care, la 409,8 ft (124,9 m) deasupra nivelului mării, este cel mai înalt deal de pe coasta de est la sud de Maine. Vârful crestei este în mare parte acoperit de păduri ca parte a Centurii Verzi a Insulei Staten.
.