Estruturas de actina e complexos de actina. As estruturas dos complexos de actina são mostradas à escala e em ordem cronológica de publicação. (a) Vista clássica da estrutura do actin monomer. A estrutura mostrada foi derivada do complexo com DNase I, com preenchimento do terminal C do complexo de actina com profilin. Destacam-se em laranja os loops Ser14 e metilados His73, o laço de ligação DNase I, e a dobradiça entre domínios, constituída pela hélice Gln137-Ser145 e o laço centrado no resíduo Lys336. Os sub-domínios 1–4 são rotulados. (Eles também são etiquetados em painéis f e m, que mostram vistas rotativas da estrutura). Juntos, os subdomínios 1 e 2 formam o domínio exterior (ou pequeno), enquanto os subdomínios 3 e 4 constituem o domínio interior (ou grande). Duas grandes fendas são formadas entre estes domínios: as fendas nucleotídicas e as fendas de ligação ao alvo. A maioria das proteínas actínicas ligantes (ABPs) e pequenas moléculas ligam-se na fenda de ligação ao alvo, e a interacção envolve frequentemente uma hélice α (magenta). (b) DNase I (1ATN). (c) Gelsolin segmento 1 (G1) (1EQY). Veja também a Figura Suplementar 1 para estruturas de actina com fragmentos de Gelsolin G1–G3 e G4–G6. (d) β-actin-profilina (2BTF). (e) Vitamina D – proteína ligante ( DBP ) (1KXP). (f) Duas vistas perpendiculares de uma sobreposição de estruturas de complexos de actina com pequenas moléculas, incluindo toxinas marinhas (1QZ5, 1QZ5, 1S22, 1YXQ, 2ASM, 2ASO, 2ASP, 2FXU, 2Q0R, 2Q0U, 2VYP), Latrunculina B (2Q0U) e citocassina D (3EKS). As toxinas marinhas (magenta) ligam-se nas extremidades da fenda de ligação ao alvo, enquanto a citochalasina D liga-se no meio, e a latrunculina (tanto A como B) liga-se na fenda do nucleotídeo. Todas estas moléculas comprometem a polimerização da actina. (g) β – domínio da timosina. Uma estrutura completa deste complexo não está disponível, mas combinadas, as estruturas da porção N-terminal de um domínio β-thymosin de Drosophila ciboulot (1SQK) e a extremidade C-terminal do peptídeo b-thymosin (Tβ4) (1T44) fornecem um modelo deste complexo. (h) Domínio WASP homology 2 (WH2) domínio WASP (2A3Z). O domínio WH2, presente em muitas proteínas citoesqueléticas na forma de repetições tandem, está relacionado com o domínio β-thymosin, mas carece da hélice de limite de ponta C-terminal. (i) Domínio Formin homology 2 (FH2) (1Y64). Veja também a Figura Complementar 2 para uma representação mais detalhada desta estrutura. (j) Ternary complex com profilin e os domínios Pro-rich G-actin-binding (Pro-rich-GAB) de VASP (2PBD). O domínio GAB está relacionado com o domínio WH2 mas apresenta uma hélice N-terminal mais curta e adota uma orientação ligeiramente diferente quando vinculado ao actin, possivelmente porque é projetado para co-ligar com o profilin. (k) Toxofilina de Toxoplasma gondii ligada a um dímero de actina antiparalela (2Q97). (l) Domínio RPEL (motivo contendo RPxxxEL) do coactivador de factor de resposta sérica MAL (2V52). (m) Arginina ADP-ribosilação iota-toxina de Clostridium perfringens (3BUZ). Vista rodada a 90° em relação aos outros complexos. (n) Domínio C-terminal ADF/cofilina de twinfilin (3DAW). Veja a Tabela Complementar 1 para uma lista completa de referências.