A estação abriu juntamente com as outras estações COASTER quando o serviço ferroviário começou em 27 de fevereiro de 1995, servindo as comunidades do sul de Carlsbad, em contraste com a estação Carlsbad Village.
Em 7 de outubro de 2013, o Amtrak Pacific Surfliner começou a parar em quatro estações COASTER: Carlsbad Village, Carlsbad Poinsettia, Encinitas, e Sorrento Valley. Amtrak largou o serviço para Carlsbad Poinsettia e Encinitas em 9 de outubro de 2017 devido ao baixo nível de ridership.
Com o aumento do ridership e a demanda por expansão, a estação passou por uma renovação de trinta e quatro milhões de dólares a partir de maio de 2018. As plataformas foram aumentadas para 300 m (1.000 pés) para acomodar trens mais longos, e também foram levantadas para facilitar a acessibilidade e o embarque. Foi construída uma passagem inferior para peões (substituindo as duas passagens de peões em ambos os extremos das plataformas) e foram colocadas vedações entre os trilhos, permitindo a passagem de dois comboios de uma só vez pela estação. Além disso, as vias e as plataformas foram realinhadas ligeiramente a oeste das suas antigas localizações, tendo sido instalada uma nova sinalização e toldos. O projecto foi eventualmente concluído em Fevereiro de 2020.