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細菌学で最も広く用いられているグラム染色は、複雑で差のある染色法である。 一連の染色と脱色のステップを経て、Domain Bacteriaに属する生物は細胞壁の組成によって区別される。 グラム陽性菌の細胞壁は、ペプチドグリカンの厚い層を含んでいる(細胞壁の90%)。 これらは紫色に染色される。 グラム陰性菌は、細胞壁がペプチドグリカンの薄い層(壁の10%)で、脂質を多く含んでいる。 ピンク色に染まる。 アルケアや真核生物はペプチドグリカンを持たないので、この染色法は用いない。 グラム染色は、熱固定した塗抹標本に一次染色(クリスタルバイオレット)を施し、次に媒染剤(グラムヨード)を加え、アルコール、アセトン、またはアルコールとアセトンの混合液で速やかに脱色し、最後にサフラニンで対比染色する4段階の基本手順が必要です。
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