繁殖
エンペラーペンギンは、大きなコロニーで繁殖する。 繁殖は3月下旬から4月上旬にかけて、オスとメスが海での採餌から戻ってきたときに行われる。 巣がなく、コロニーがとてつもなく大きいにもかかわらず、成鳥の15％ほどは前年の伴侶を見つけることができる。
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繁殖のタイミングは、長い発育期間を経て、最も生存率の高い真夏に完全な羽化した雛が生まれるようにするためらしいです。 その結果、南極の冬が始まる直前の5月下旬から6月上旬に1個の卵が産まれる。 抱卵はオスが独占的に行い、産卵後すぐに開始される。 その間、メスはコロニーから海まで約80〜160kmの旅に出て、抱卵が終わるまで戻ってこない。 強風と-50℃を下回る極寒の中、孵化は60〜68日間続く。 餌がないため、オスは蓄えた脂肪で生活する。 オスは卵を足の甲に乗せ、その上に皮膚をかぶせて厳しい環境から卵を守る。
8月に雛が孵化し、雌は雄を助けるためにコロニーに戻る。 ヒナは、南極の氷の寒さに耐えられるようになるまで、両親のどちらかの足で立っている。 しかし、孵化したばかりのヒナにとって脅威となるのは、寒さだけではない。 コロニー内には卵やヒナを失った「失業者」の成鳥が増え、そうした鳥が子を持つ親の邪魔をしてヒナの死亡率を高めることが知られている。
多くの若い皇帝ペンギンが寒さと外敵から身を守るためにグループを作るクレッシュ期には、ふわふわした羽毛の覆いは短い硬い羽毛に変わり、その成分は大人のそれと似ているが通常は多少色が異なっている。 この脱皮が終わると、幼鳥はコロニーを離れ、海で自分の餌を探すようになる。 5年目からはコロニーに戻り、繁殖する。 エンペラーペンギンは野生で20年、飼育下では50年生きるといわれている
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