今から約2500年前、ペルシャ帝国はアジアを経て小アジア（黒海と地中海の間の地域）に進出し、東方世界を支配していた。 征服したすべての都市国家の上にペルシャの支配者が設置されました。
BC550年頃、ペルシャ皇帝キュロス1世がイオニア地方（現代トルコの西海岸）を征服し、イオニア人の反乱を引き起こし、ギリシャ帝国とペルシャ帝国の長い対立の始まりとなった。 科学と数学の進歩のために、これらの確立された都市国家は、ギリシャで最も顕著であったようだ。 イオニアの人々は、独裁的な新しい支配者に不満を持っていた。 ペルシャの支配者たちは、このような民衆の感情を知っていたが、敵対関係を緩和することはほとんどしなかった。 紀元前500年頃、ペルシャ西部の首都サルディスを治めていたアルタフレネスは、イオニア地方の指導者たちと会談を行った。 彼らの多くが権力と土地の獲得に不安を抱いているのを見て、互いに攻撃しないことを約束させた。 アルタフレネスは、内部対立が帝国の崩壊につながることを知っていた。
BC499年、イオニアの都市ミレトスの支配者アリスタゴラスは、ナクソス市を支配することを熱望していた。 彼は周辺の都市から援助を得ようとしたが失敗した。 ダレイオス1世（BC521-486、ペルシャ皇帝）あるいはアルタフレネスからの協定違反の処罰を恐れ、彼は反乱を起こした。 アリスタゴラスはイオニア人に指導者を解任するように勧めた。 これを受けて、この地域の多くの都市が反乱を起こし、ペルシャの支配者を追い出した。 ダレイオスの報復が近いことを知ったアリストゴラスは、スパルタに行き、クレオメネス王に援助を訴えた。 しかしスパルタの指導者は、イオニア軍を援軍するために移動する距離を知り、援助の要請を断った
アリスタゴラスは、支援を求めてアテネに赴いた。 アテネはペルシャの不可避な攻撃を恐れ、アリストゴラスを支援することを決定し、20隻のトリレムとエレトリアからの5隻のトリレムを派遣した。 アテネとエレトリアの船で強化されたイオニア艦隊は、前498年にエフェソスに出航した。 船はコレッソス港に係留され、兵士たちはケイスター川に沿ってサルディスへ向かった。 ギリシャ連合軍は市内に進軍し、ほとんど抵抗を受けなかった。 市内に入ると、ついに城塞を守るアルタフレネス（サルディスの支配者）と交戦した。 城塞を占領することはできなかったが、イオニア軍は都市に火を放ち、エフェソスに退却した。 この地域にいたペルシャ軍はエフェソスでギリシア軍と出会い、そのほとんどを虐殺した。
多くの兵士を失うという大きな挫折にもかかわらず、アリストゴラスはペルシャとの戦いを続けた。 彼は小アジア西部、トラキア、キプロスでさらに反乱を奨励した。 アリストゴラスは艦隊の一部を派遣してキプロス軍を助けたが、ペルシャ軍はキプロス軍を完敗させた。 ダレイオス1世は、アリストゴラスの都市ミレトスと関係の深いカリアを攻撃することにした。 この計画を知ったカリア人は、夜な夜なペルシャ軍を待ち伏せして全滅させた。 この戦いでペルシャの4人の将軍が死んだ。 彼らの死は大きな損失であったが、ペルシャは都市を取り戻し続けた。
反乱の崩壊を見たアリスタゴラスは、命をかけてミクリヌスに逃亡した。 彼はミレトスの指揮を数学者ピタゴラスに委ねた。
アリストゴラスがミレトスを去った後、ペルシャ艦隊がラデに出撃し、都市を守るギリシャ艦隊を撃破した。 ダリウスとその軍隊はBC494年にミレトスを占領した。 都市国家が陥落した後、ペルシャ帝国の反乱は指導力の欠如により崩壊した。
この反乱はいくつかの永続的な影響を与えた。 イオニア啓蒙が終了した。 ダレイオス1世はアテネがイオニア人に与えた援助により、アテネに対する怒りを募らせ、ギリシャを侵略する動機を与えた。 反乱は帝国が不安定であり、内部紛争に弱いことを明確に示したのである。 アトラス・オブ・クラシカル・ヒストリー. ニューヨーク。 Oxford University Press, 1994.
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