Estructuras de actina y complejos de actina. Las estructuras de los complejos de actina se muestran a escala y en orden cronológico de publicación. (a) Vista clásica de la estructura del monómero de actina. La estructura mostrada se derivó del complejo con la DNasa I, completándose el extremo C a partir del complejo de actina con la profilina. Resaltados en naranja están los bucles Ser14 y His73 metilado, el bucle de unión a la DNasa I y la bisagra entre dominios, formada por la hélice Gln137-Ser145 y el bucle centrado en el residuo Lys336. Los subdominios 1 a 4 están marcados. (También están etiquetados en los paneles f y m, que muestran vistas rotadas de la estructura). Juntos, los subdominios 1 y 2 forman el dominio exterior (o pequeño), mientras que los subdominios 3 y 4 constituyen el dominio interior (o grande). Entre estos dominios se forman dos grandes hendiduras: la hendidura de unión al nucleótido y la hendidura de unión a la diana. La mayoría de las proteínas de unión a actina (ABP) y las moléculas pequeñas se unen en la hendidura de unión a la diana, y la interacción suele implicar una α-hélice (magenta). (b) DNasa I (1ATN). (c) Gelsolina segmento 1 (G1) (1EQY). Véase también la figura suplementaria 1 para las estructuras de la actina con los fragmentos de gelsolina G1–G3 y G4–G6. (d) β-actina-profilina (2BTF). (e) Proteína de unión a la vitamina D ( DBP ) (1KXP). (f) Dos vistas perpendiculares de una superposición de estructuras de complejos de actina con pequeñas moléculas, incluyendo toxinas marinas (1QZ5, 1QZ5, 1S22, 1YXQ, 2ASM, 2ASO, 2ASP, 2FXU, 2Q0R, 2Q0U, 2VYP), Latrunculina B (2Q0U) y citocalasina D (3EKS). Las toxinas marinas (magenta) se unen en los extremos de la hendidura de unión a la diana, mientras que la citocalasina D se une en el centro, y la latrunculina (tanto A como B) se une en la hendidura de los nucleótidos. Todas estas moléculas comprometen la polimerización de la actina. (g) Dominio de β-timosina. No se dispone de una estructura completa de este complejo, pero combinadas, las estructuras de la porción N-terminal de un dominio de β-timosina de Drosophila ciboulot (1SQK) y el extremo C-terminal del péptido de b-timosina (Tβ4) (1T44) proporcionan un modelo de este complejo. (h) Dominio de homología 2 (WH2) de WASP (2A3Z). El dominio WH2, presente en muchas proteínas del citoesqueleto en forma de repeticiones en tándem, está relacionado con el dominio de la β-timosina pero carece de la hélice de remate del extremo C-terminal. (i) Dominio de homología de la formina 2 (FH2) (1Y64). Véase también la Figura Suplementaria 2 para una representación más detallada de esta estructura. (j) Complejo ternario con profilina y los dominios de unión a G-actina ricos en Pro (Pro-rich-GAB) de VASP (2PBD). El dominio GAB está relacionado con el dominio WH2 pero presenta una hélice N-terminal más corta y adopta una orientación ligeramente diferente cuando se une a la actina, posiblemente porque está diseñado para unirse conjuntamente con la profilina. (k) Toxofilina de Toxoplasma gondii unida a un dímero de actina antiparalelo (2Q97). (l) Dominio RPEL (RPxxxEL-containing motif) del coactivador del factor de respuesta sérica MAL (2V52). (m) Arginina ADP-ribosylation iota-toxina de Clostridium perfringens (3BUZ). Vista girada 90° respecto a los otros complejos. (n) Dominio ADF/cofilina C-terminal de la twinfilina (3DAW). Véase la tabla suplementaria 1 para una lista completa de referencias.