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A. Bacterias heterótrofas (Heterotrophs):
Son las más abundantes en la naturaleza. No sintetizan su propio alimento sino que dependen de otros organismos o de la materia orgánica muerta para alimentarse. Pueden ser parásitos, saprofitos o simbiontes.
(a) Parásitos:
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Viven sobre otros organismos llamados huéspedes, de los que obtienen el alimento. Por ejemplo, Streptococcus, Clostridium, Mycobacterium tuberculosis, etc. Los parásitos causantes de enfermedades se denominan patógenos.
(b) Saprofitos:
Son los principales descomponedores de la naturaleza. Obtienen su alimento de los detritus, es decir, de las materias orgánicas muertas, mediante la fermentación (descomposición anaeróbica de los hidratos de carbono), la putrefacción (descomposición anaeróbica de las proteínas) y la descomposición (descomposición aeróbica de los compuestos orgánicos).
(c) Simbiontes:
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Viven en asociación simbiótica con otras plantas para beneficio mutuo. Unas pocas especies de Rhizobium, como R. leguminosarum, viven en los nódulos de las raíces de las leguminosas formando una íntima relación simbiótica. Las bacterias fijan el nitrógeno atmosférico para la planta y a cambio obtienen protección. Escherichia coli vive en el intestino humano como comensal. Se alimenta de materia no digerida, controla el crecimiento de las bacterias de la putrefacción y produce vitaminas B y K. La presencia de E. coli en el suministro de agua indica contaminación por aguas residuales.
B. Bacterias Autótrofas (Autotrofos):
Sintetizan su propio alimento orgánico a partir de sustancias inorgánicas (CO2 y donante de hidrógeno) Las bacterias autótrofas son de dos tipos:
(i) fotoautótrofas (fotosintéticas) que aprovechan la energía lumínica y
(ii) quimioautótrofas (quimiosintéticas) que utilizan energía química.
(i) Bacterias fotoautótrofas (Fotoautótrofos):
Utilizan la energía solar para la síntesis de su propio alimento. Estas bacterias son anaerobias y pueden ser de color púrpura o verde. Las bacterias púrpuras poseen el pigmento bacterioclorofila situado en las membranas de los tilacoides, mientras que las bacterias verdes poseen la bacteriofaetina (clorofila clorobiana) situada dentro de unos pequeños sacos llamados clorosomas.
Los fotoautótrofos realizan una fotosíntesis anoxigénica en la que no se utiliza el agua como poder reductor. En su lugar, se utilizan compuestos de azufre como el sulfuro de hidrógeno (H2S), el hidrógeno gaseoso (H2), los tiosulfatos (Na2S203) o algunos compuestos orgánicos para obtener poder reductor. La mayoría de los fotoautótrofos viven cerca de los fondos de estanques y lagos donde el azufre reducido u otros compuestos son abundantes y el contenido de oxígeno es muy bajo.
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(ii) Bacterias quimioautótrofas (quimioautótrofos):
No tienen pigmento fotosintético y por lo tanto utilizan energía química para reducir el CO2 a alimento orgánico. La energía química se obtiene de la oxidación de ciertas sustancias químicas como el amoníaco, los nitritos, el metano, el monóxido de carbono, el hidrógeno molecular, las sales de hierro, el azufre y los compuestos de azufre (por ejemplo, las bacterias nitrificantes Nitrosomonas, Nitrobacter, las bacterias desnitrificantes Bacillus denitrificans, las bacterias del azufre Thiobacillus thiooxidans, las bacterias del hierro, las bacterias del hidrógeno).