Las células madre pluripotentes inducidas (iPS) poseen pluripotencia y capacidad de autorrenovación. Por lo tanto, se espera que las células iPS sean útiles en la medicina regenerativa. Sin embargo, las células iPS forman teratomas inmaduros malignos tras el trasplante en animales, incluso después de la inducción de la diferenciación. Se ha sugerido que las células indiferenciadas que expresan Nanog y que permanecen tras la inducción de la diferenciación son responsables de la formación de teratomas. Por lo tanto, se han investigado varios métodos para eliminar estas células indiferenciadas, pero pocos métodos implican enfoques morfológicos, que pueden inducir menos daño celular. Además, para que las células derivadas de las células iPS se apliquen en la medicina regenerativa, deben estar vivas. Sin embargo, no se ha realizado un análisis morfológico detallado de las células indiferenciadas vivas. Por las razones anteriores, evaluamos las características morfológicas de las células indiferenciadas vivas que quedan después de la inducción de la diferenciación como una investigación básica para la aplicación clínica de las células iPS. Como resultado, las células indiferenciadas vivas que quedaban tras la inducción de la diferenciación mostraban un citoplasma redondo u ovalado de unos 12 μm de diámetro y un núcleo. Presentaban una relación núcleo-citoplasma (N/C) de aproximadamente el 60% y núcleos excéntricos, y poseían estructuras parcialmente granulares en el citoplasma y nucleolos prominentes. Aunque eran similares a las células iPS, eran más pequeñas que las células iPS vivas. Además, había células muy pequeñas entre las células indiferenciadas tras la inducción de la diferenciación. Estos resultados sugieren que la eliminación de las células indiferenciadas puede ser posible utilizando las características morfológicas de las células iPS vivas y las células indiferenciadas después de la inducción de la diferenciación. Además, este estudio apoya la medicina regenerativa segura utilizando células iPS.