Struktura aktinu a aktinových komplexů. Struktury aktinových komplexů jsou zobrazeny v měřítku a v chronologickém pořadí zveřejnění. (a) Klasický pohled na strukturu monomeru aktinu. Zobrazená struktura byla odvozena z komplexu s DNázou I, s doplněním C-konce z komplexu aktinu s profilinem. Oranžově jsou zvýrazněny smyčky Ser14 a metylovaný His73, vazebná smyčka DNázy I a závěs mezi doménami, který se skládá ze šroubovice Gln137-Ser145 a smyčky se středem na zbytku Lys336. Subdomény 1-4 jsou označeny. (Jsou označeny také v panelech f a m, které ukazují otočené pohledy na strukturu.) Subdomény 1 a 2 společně tvoří vnější (neboli malou) doménu, zatímco subdomény 3 a 4 tvoří vnitřní (neboli velkou) doménu. Mezi těmito doménami jsou vytvořeny dvě velké štěrbiny: nukleotidová a cílová vazebná štěrbina. Většina aktin-vázajících proteinů (ABP) a malých molekul se váže ve štěrbině vázající cíl a interakce často zahrnuje α-helix (purpurová). (b) DNáza I (1ATN). (c) Gelsolinový segment 1 (G1) (1EQY). Struktury aktinu s fragmenty Gelsolinu G1–G3 a G4–G6 viz také doplňkový obrázek 1. (d) β-aktin-profilin (2BTF). (e) Protein vázající vitamin D ( DBP ) (1KXP). (f) Dva kolmé pohledy na superpozici struktur aktinových komplexů s malými molekulami, včetně mořských toxinů (1QZ5, 1QZ5, 1S22, 1YXQ, 2ASM, 2ASO, 2ASP, 2FXU, 2Q0R, 2Q0U, 2VYP), latrunculinu B (2Q0U) a cytochalasinu D (3EKS). Mořské toxiny (purpurová) se vážou na koncích cílové vazebné štěrbiny, zatímco cytochalasin D se váže uprostřed a latrunculin (A i B) se váže v nukleotidové štěrbině. Všechny tyto molekuly ohrožují polymerizaci aktinu. (g) β-thymosinová doména. Kompletní struktura tohoto komplexu není k dispozici, ale v kombinaci struktur N-koncové části β-thymosinové domény z cibulky Drosophila (1SQK) a C-konce peptidu b-thymosinu (Tβ4) (1T44) poskytují model tohoto komplexu. (h) Homologní doména 2 (WH2) domény WASP (2A3Z). Doména WH2, která je přítomna v mnoha cytoskeletálních proteinech ve formě tandemových repetic, je příbuzná s doménou β-thymosinu, ale postrádá C-terminální špičatý koncový uzavírací šroubovici. (i) Doména homologie forminu 2 (FH2) (1Y64). Podrobnější znázornění této struktury viz také doplňkový obrázek 2. (j) Ternární komplex s profilinem a doménami VASP bohatými na Pro a vázajícími G-aktin (Pro-rich-GAB) (2PBD). Doména GAB je příbuzná doméně WH2, ale představuje kratší N-koncový šroubovici a při vazbě na aktin zaujímá poněkud odlišnou orientaci, pravděpodobně proto, že je určena ke společné vazbě s profilinem. (k) Toxofilin z Toxoplasma gondii vázaný na antiparalelní dimer aktinu (2Q97). (l) RPEL (RPxxxEL-containing motif) doména z koaktivátoru MAL faktoru sérové odpovědi (2V52). (m) Arginin ADP-ribosylační iota-toxin z Clostridium perfringens (3BUZ). Pohled otočený o 90° vzhledem k ostatním komplexům. (n) C-koncová ADF/kofilinová doména twinfilinu (3DAW). Úplný seznam referencí viz doplňková tabulka 1.
.