Lidský rhinovirus.Wellcome Images. Rhinoviry jsou hlavní příčinou běžného nachlazení a mohou se podílet na přibližně polovině případů vzplanutí astmatu. Vědci nyní dokončili sekvenování genomů všech známých typů rhinovirů, čímž připravili půdu pro vývoj léků a vakcín proti těmto virům.
Nachlazení je nejběžnější známé onemocnění, které přináší kýchání, škrábání v krku a rýmu, jež všichni dobře známe. Odhaduje se, že lidé ve Spojených státech ročně prodělají 1 miliardu nachlazení.
Je známo více než 200 různých virů, které způsobují příznaky běžného nachlazení. Odhaduje se, že 30-35 % všech nachlazení dospělých je způsobeno rhinoviry. U lidí s astmatem, zejména u dětí, jsou rinovirové infekce také často spojeny se vzplanutím. Vědci již dříve identifikovali 99 různých typů rhinovirů. Nedávno však byla u pacientů s těžkými chřipkovými onemocněními zjištěna řada neznámých typů.
Výzkumný tým vedený Dr. Stephenem B. Liggettem z University of Maryland School of Medicine usoudil, že strategie boje proti rhinovirům bude záviset na lepším pochopení rozmanitosti a evoluce rhinovirů. Tým se rozhodl z interních prostředků dokončit genetické sekvence všech známých typů rhinovirů. Na analýze spolupracovala Dr. Ann Palmenbergová z Wisconsinské univerzity v Madisonu, která je podporována Národním ústavem pro alergie a infekční choroby (NIAID). Výsledky se objevily v časopise Science 3. dubna 2009.
Vědci sekvenovali kompletní genomy 70 známých lidských rhinovirů a 10 dalších ze vzorků nosní vody pacientů s rhinovirovými infekcemi horních cest dýchacích. Konečná kolekce včetně dříve publikovaných sekvencí obsahovala 138 genomů lidských rhinovirů v plné délce.
Vědci porovnali všechny sekvence, aby zjistili, jak jsou si příbuzné. Na základě těchto příbuzností zjistili, že mohou existovat až 4 různé druhy rhinovirů.
Rhinoviry obsahují veškerou svou genetickou informaci na jediném vlákně RNA (molekula příbuzná DNA). Vědci zjistili, že všechna vlákna RNA virů mají na jednom konci tvar podobný jetelovému listu. Téměř každý virus měl v části této oblasti jedinečnou sekvenci. Ukázalo se, že analogické oblasti u příbuzných virů ovlivňují to, jak jsou viry patogenní. Vědci se domnívají, že tento úsek sekvence by mohl hrát podobnou roli i u rhinovirů.
Vědci také našli důkazy o tom, že si vzdáleně příbuzné kmeny vyměňují úseky RNA. Kde přesně a jak si viry v těle vyměňují genetický materiál, není jisté, ale je známo, že více rhinovirů infikuje lidi současně.
Výsledky této studie poskytují rámec pro analýzu lidských rhinovirů, které mohou v budoucnu udeřit. Tyto informace lze využít ve studiích sledujících pohyb a vývoj nových virů. Mohou se také ukázat jako cenné pro vývoj antivirových léků a vakcín.
od doktora Harrisona Weina
.