Kilju lze vyrobit kvašením cukru, kvasnic a vody, ale kilju vyrobené výhradně z cukru, kvasnic a vody bylo ve Finsku před březnem 2018 nelegální, proto se při kvašení používalo obilí, brambory, ovoce nebo bobule, aby se předešlo problémům se zákonem a nápoj se ochutil. K tomuto účelu se s oblibou používají pomeranče a citrony.
Postup je podobný jako při domácí výrobě vína; vyžaduje přísnou hygienu a filtraci produktu. Správně vyrobené kilju je čirá, bezbarvá tekutina bez zřetelné chuti kromě chuti ethanolu. Destilací ji lze upravit na pontikku (finskou pálenku). Pak se podobá rumu, protože oba se destilují z fermentovaných produktů z třtinového cukru, ačkoli rum se často vyrábí z melasy, vedlejšího produktu procesu rafinace cukru, nebo z čerstvé šťávy z cukrové třtiny namísto rafinovaného, zkrystalizovaného stolního cukru.
Kilju je často vyráběno nesprávně domácími pivaři, kteří dovolí, aby nečistoty narušily kvašení, nebo tekutinu dostatečně nefiltrují či nepřefiltrují, případně nepoužívají zjemňující prostředek. Posledně jmenované chyby mají za následek, že kvasnice jsou suspendovány, což způsobuje, že směs je spíše zakalená než čirá. Kvasinky nejsou škodlivé, ale mohou způsobit nepříjemnou chuť.
Když během hospodářské krize, která následovala po finské bankovní krizi na počátku 90. let 20. století, vzrostla obliba domácího vaření piva, byly na trh uvedeny kmeny kvasinek známé jako „turbo kvasinky“. Tyto kmeny kvasinek umožňují velmi rychlé kvašení do plné síly, v některých případech již za tři dny (ve srovnání s několika týdny, které vyžadují tradiční kmeny vinných kvasinek). Takto krátká doba výroby přirozeně neumožňuje, aby kvasinky zkvasily. Zavedení turbo kvasinek posílilo názor veřejnosti na kilju jako na snadný způsob získávání levného alkoholu.