V roce 1938 Price63 zjistil, že bakterie získané z rukou lze rozdělit do dvou kategorií, a to na rezidentní nebo přechodné. Rezidentní flóra (rezidentní mikrobiota) se skládá z mikroorganismů sídlících pod povrchovými buňkami rohové vrstvy a může se nacházet i na povrchu kůže.64,65 Dominantním druhem je stafylokok epidermidis66 a rezistence k oxacilinu je mimořádně vysoká, zejména u HCW.67 Mezi další rezidentní bakterie patří S. hominis a další koaguláza-negativní stafylokoky, dále pak koryneformní bakterie (propionibakterie, korynebakterie, dermobakterie a mikrokoky).68 Z hub je nejčastějším rodem rezidentní kožní flóry, pokud je přítomna, Pityrosporum (Malassezia) spp.69 V případě, že je přítomna, je nejčastějším rodem kožní flóra. Rezidentní flóra má dvě hlavní ochranné funkce: mikrobiální antagonismus a soupeření o živiny v ekosystému.70 Obecně je méně pravděpodobné, že rezidentní flóra bude spojena s infekcemi, ale může způsobit infekce ve sterilních tělních dutinách, v očích nebo na neporušené kůži.71
Přechodná flóra (tranzientní mikrobiota), která kolonizuje povrchové vrstvy kůže, je lépe odstranitelná běžnou hygienou rukou. Přechodné mikroorganismy se na kůži obvykle nemnoží, ale přežívají a sporadicky se množí na povrchu kůže.70 Často je HCW získávají při přímém kontaktu s pacienty nebo kontaminovanými povrchy prostředí v sousedství pacienta a jsou to organismy nejčastěji spojené s HCAI. Některé typy kontaktu během rutinní péče o novorozence jsou častěji spojeny s vyšší mírou bakteriální kontaminace rukou HCW: respirační sekrety, výměna plen/plínek a přímý kontakt s kůží.72,73 Přenosnost přechodné flóry závisí na přítomných druzích, počtu mikroorganismů na povrchu a vlhkosti kůže.74,75 Ruce některých HCW mohou být trvale kolonizovány patogenní flórou, jako je S. aureus, gramnegativní bacily nebo kvasinky.76
Normální lidská kůže je kolonizována bakteriemi, přičemž celkový počet aerobních bakterií se pohybuje od více než 1 × 106 jednotek tvořících kolonie (CFU)/cm2 na pokožce hlavy, 5 × 105 CFU/cm2 v podpaží a 4 × 104 CFU/cm2 na břiše až po 1 × 104 CFU/cm2 na předloktí.77 Celkový počet bakterií na rukou HCW se pohyboval od 3,9 × 104 do 4,6 × 106 CFU/cm2. 63,78-80 Kontaminace konečků prstů se při odběru vzorků kontaktní agarovou metodou pohybovala v rozmezí od 0 do 300 CFU.72 Price a následní vyšetřovatelé zdokumentovali, že ačkoli se počet přechodné a rezidentní flóry u jednotlivých osob značně liší, je často u dané osoby relativně konstantní.63,81